电动车车主在交通事故中受伤住院，合作医疗能否报销需根据具体情况判断，以下是详细分析：

一、可以报销的情况

1. 骑车人自身原因导致的意外

   • 解释：如果电动车事故完全是骑车人自身原因导致，比如自己不小心摔倒受伤，且没有其他第三方责任涉及，那么产生的符合医保报销范围的医疗费用，合作医疗通常是可以报销的。
   • 建议：在这种情况下，骑车人需按照合作医疗程序进行登记，并提供必要的报销材料，如身份证或户口簿原件及复印件、新农合医保卡、门诊病历、出院小结原件及复印件、医疗费用原始收据以及费用明细清单等。

2. 特殊情况下第三人无法支付

   • 解释：若电动车事故中存在第三方责任，但第三人不支付或者无法确定第三人，经过相关部门核实、审批等程序后，合作医疗也可能会在一定范围内先行支付医疗费用，并有权向第三人追偿。
   • 建议：骑车人应及时向相关部门报告事故情况，并配合进行核实和审批程序，以便尽快获得医疗费用的报销。

二、不可以报销的情况

1. 存在明确的第三方责任

   • 解释：根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，如果电动车事故中存在第三方责任，且第三方已经或应当承担赔偿责任，那么合作医疗通常不会进行报销。这是因为合作医疗的报销原则是在没有第三方责任的情况下对参保人的医疗费用进行补偿。
   • 建议：在这种情况下，骑车人应向第三方责任人主张赔偿，而不是依赖合作医疗进行报销。

2. 骑车人全责事故

   • 解释：在电动车事故中，如果行为人（骑车人）负全责，那么所产生的医疗费用应由行为人自己承担，合作医疗同样不会进行报销。
   • 建议：骑车人应增强安全意识，遵守交通规则，以减少事故的发生和不必要的经济损失。

三、报销的具体条件和流程

1. 报销范围

   • 合作医疗的报销范围通常包括参保人员因病在定点医院住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合报销规定的部分。

2. 报销条件

   • 除了需要符合合作医疗的报销范围外，还需要满足一定的报销条件，如按照规定进行登记、提供完整的报销材料等。特别需要注意的是，入院时应按合作医疗程序进行登记，否则出院后可能无法报销。

3. 报销流程

   • 报销流程一般包括准备出院记录、病历、疾病诊断等材料（需加盖印章），并携带发票和上述材料到医保报销部门进行报销。确认信息无误后，报销金额将在一定工作日内到达指定账户。

4. 所需材料

   • 身份证或户口簿原件及复印件、新农合医保卡、门诊病历、出院小结原件及复印件、医疗费用原始收据以及费用明细清单等。如果是委托他人办理报销手续，还需提供受托人的身份证及复印件。

四、结论与建议

综上所述，电动车事故合作医疗能否报销取决于具体的事故情况和责任归属。在发生电动车事故后，建议骑车人及时咨询当地合作医疗经办机构或相关部门以获取最准确的信息和指导。同时，骑车人也应增强安全意识，遵守交通规则，以减少事故的发生。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。