在保证书中明确约定“不能作为离婚证据”的条款，从法律实践角度，其效力存在不确定性，但可通过以下方式尽量降低被认定为离婚证据的风险：

1. 明确条款表述
   在保证书中增加类似以下条款：“本保证书内容仅用于约束双方婚姻关系存续期间的行为，不得作为任何一方提出离婚诉讼或主张离婚损害赔偿的证据使用。若因本保证书引发离婚纠纷，双方均承诺不向法院提交本保证书作为证据。”
   注意：此类条款需双方自愿签署，且不得违反法律强制性规定（如不得以条款排除法定离婚事由或损害赔偿请求权）。

2. 限制条款效力范围
   可进一步细化条款效力，例如：“本保证书仅对双方婚姻关系存续期间的特定行为（如忠诚义务、财产管理）具有约束力，不涉及婚姻关系解除的实体条件或程序事项。任何一方不得以本保证书作为主张离婚或分割财产的直接依据。”
   原理：通过限定条款适用范围，避免与《民法典》中离婚法定事由（如重婚、家暴、分居等）产生直接关联，从而降低被法院采信为离婚证据的可能性。

3. 结合公证或见证程序
   若双方希望增强条款效力，可对保证书进行公证或邀请第三方见证（如律师、居委会工作人员），并在条款中注明：“本保证书经公证/见证，双方确认签署目的仅为维护婚姻关系稳定，不涉及离婚相关权益主张。”
   风险提示：公证或见证仅能证明签署真实性，无法完全排除条款因违反公序良俗或法律强制性规定而被认定无效的风险。

4. 避免与离婚事由直接关联
   保证书内容应避免涉及《民法典》第1079条规定的离婚法定事由（如家庭暴力、虐待、遗弃等），否则即使约定“不能作为离婚证据”，法院仍可能根据案件事实直接认定相关行为构成离婚事由。
   示例：若保证书约定“一方出轨需赔偿对方10万元”，此类条款可能被法院认定为“忠诚协议”，其效力存在争议，但若出轨行为同时构成《民法典》第1079条规定的“重婚或与他人同居”，则保证书内容仍可能被作为辅助证据采信。

重要提醒：

• 保证书本质属于民事合同，其效力受《民法典》合同编调整。若条款内容违反法律强制性规定或公序良俗（如限制离婚自由、排除法定损害赔偿请求权），则可能被认定无效。
  
• 法院在审理离婚案件时，会综合全案证据（包括保证书、证人证言、视听资料等）判断夫妻感情是否破裂及是否存在法定离婚事由，单一保证书条款无法完全排除其被作为证据使用的风险。
  
• 若需进一步设计合法有效的婚姻关系约束条款，建议结合具体需求咨询专业律师，避免因条款设计瑕疵导致目的落空。