在破产案件中，有财产担保的债权的清偿顺序是一个涉及多方利益和复杂法律关系的重要问题。以下是根据《中华人民共和国企业破产法》和《中华人民共和国民法典》的相关规定，对这一问题的详细解答：
一、总体清偿顺序原则
在破产程序中，债权的清偿顺序遵循一定的法律原则，以确保公平、公正地处理各方债权。具体来说，清偿顺序大致如下：
破产费用和共益债务：这些费用是破产程序顺利进行所必需的，因此享有优先清偿权。它们包括破产案件的诉讼费用、管理费用、变价和分配债务人财产的费用，以及管理人执行职务的费用、报酬和聘用工作人员的费用等。
职工债权：在清偿完破产费用和共益债务后，接下来清偿的是破产人所欠职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，以及应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，还有法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金。
社会保险费用和税款：在清偿完职工债权后，接着清偿的是破产人欠缴的社会保险费用和税款。
有担保的债权：根据《企业破产法》第一百零九条，对破产人的特定财产享有担保权的权利人，对该特定财产享有优先受偿的权利。这意味着，在清偿完上述费用后，有担保的债权可以就抵押物优先受偿。
普通破产债权：最后清偿的是普通破产债权，包括除上述债权以外的其他债务。如果破产财产不足以清偿同一顺序的债权，将按照比例进行分配。
二、有财产担保债权的优先受偿权
有财产担保的债权在破产程序中享有优先受偿权，这是基于物权法的原理。具体来说，如果债权人对破产人的特定财产设定了抵押权或其他担保物权，那么在该财产被处置时，债权人可以优先于其他债权人从处置所得中受偿。
三、同一财产上多个担保物权的清偿顺序
如果同一财产上存在多个担保物权，如多个抵押权，那么它们的清偿顺序将按照以下规则确定：
已登记的抵押权：按照登记的时间先后确定清偿顺序。先登记的抵押权优先于后登记的抵押权受偿。
已登记与未登记的抵押权：已登记的抵押权先于未登记的抵押权受偿。
未登记的抵押权：如果多个抵押权均未登记，那么它们将按照债权比例清偿。
四、抵押物处置后不足以清偿债权的部分
如果抵押财产在处置后所得价款不足以清偿抵押担保债权的全部金额，那么未受偿的部分将作为普通债权，按照破产财产分配方案中普通债权的清偿顺序和比例进行清偿。
五、实际操作中的注意事项
在实际操作中，处理破产案件中的抵押担保债权时，应严格按照法律法规进行清偿。这包括准确识别担保物权的类型、登记情况、债权金额等关键信息，以及按照法定顺序和比例进行清偿。同时，还应注重保护各方债权人的合法权益，确保清偿过程的公正性和合法性。
综上所述，破产案件中有财产担保的债权的清偿顺序是严格法律规定的，旨在平衡各方利益，保障不同主体的合法权益。在实际操作中，应严格按照法律法规进行清偿，确保公平、公正地处理破产案件中的各类债权。