逾期被扣的钱是否退还，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同或协议中的明确约定
有明确退款条款：
- 如果在你与相关机构（如银行、贷款公司等）签订的合同或协议中，明确规定了逾期扣款后，在满足一定条件（如提前还款、逾期原因非个人主观故意等）下可以退还部分或全部扣款，那么你有权依据合同条款要求退款。
- 示例：假设合同中规定，若逾期是由于系统故障或银行处理延迟导致，且你在发现逾期后立即采取了补救措施，那么被扣的逾期费用可以退还。
无明确退款条款或条款模糊：
- 如果合同或协议中没有明确规定逾期扣款后的退款事宜，或者条款表述模糊、存在歧义，那么退款的可能性就相对较小。
- 在这种情况下，你可以尝试与相关机构协商，看是否能达成退款协议。但协商的结果往往取决于双方的谈判能力和意愿。
二、逾期原因及责任归属
个人原因导致的逾期：
- 如果逾期是由于你个人的疏忽、遗忘或故意拖延等原因导致，那么相关机构扣款通常是合理的，且不太可能退还。
- 示例：你因忘记还款日期而导致逾期，银行按照合同约定扣除了逾期费用，这种情况下要求退款可能难以得到支持。
非个人原因导致的逾期：
- 如果逾期是由于不可抗力（如自然灾害、政府行为等）或相关机构的原因（如系统故障、处理延迟等）导致，那么你有权要求相关机构退还因逾期而被扣的费用。
- 示例：由于银行系统升级导致你无法按时还款，银行因此扣除了逾期费用，你可以要求银行退还这部分费用。
三、法律途径与维权建议
协商与投诉：
- 在发现逾期被扣款后，你首先可以尝试与相关机构进行协商，看是否能达成退款协议。
- 如果协商无果，你可以向相关机构的上级部门或监管机构进行投诉，寻求帮助和支持。
法律诉讼：
- 如果协商和投诉都无法解决问题，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
- 在提起诉讼前，建议你收集好相关证据（如合同、协议、扣款记录、沟通记录等），并咨询专业律师的意见，以确保诉讼的顺利进行。
四、特殊情况下的退款可能性
- 在某些特殊情况下，如相关机构存在违规操作、欺诈行为或违反法律法规等，你即使逾期也可能有权要求退款。
- 示例：如果贷款公司未经你同意擅自提高了逾期费用标准，或者以欺诈手段诱导你签订不合理的合同条款，你可以要求贷款公司退还多扣的费用。
建议：如果你认为逾期被扣的钱应该退还，但相关机构拒绝退款或协商无果，你可以直接向我咨询具体的法律途径和维权策略。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。