结论：欠条还清后，虽然可以直接在原欠条上写明已结清，但这种方式存在一定风险，更稳妥的做法是重新签订一份还款确认书或销毁原欠条。以下从不同角度为你详细分析：

从法律效力的角度

在原欠条上写明已结清，从法律理论上来说，如果双方都认可这一行为，并且有明确的还款时间、金额以及“已结清”等字样，同时有双方的签字或盖章确认，那么这份修改后的欠条是可以作为债务已经清偿的证据的，具有一定的法律效力。

然而，这种方式存在潜在风险。因为原欠条上的修改可能不够规范，比如字迹潦草、修改痕迹不明显等，在日后如果发生纠纷，对方可能会否认修改的内容，从而引发争议。例如，如果只是简单地用笔在原欠条上划掉部分内容，然后写上“已还清”，但没有明确还款的具体时间、方式等关键信息，也没有双方的签字确认，那么这份修改后的欠条就很难作为有力的证据。

从证据保存的角度

重新签订一份还款确认书是一种更为稳妥的方式。还款确认书可以明确记载债务的金额、还款的时间、方式以及双方确认债务已经清偿等关键信息，并且由双方签字或盖章确认。这样，在日后如果发生纠纷，这份还款确认书就可以作为直接、有力的证据，证明债务已经清偿。

另外，销毁原欠条也是一种可行的做法。在债务清偿后，双方可以共同销毁原欠条，以避免原欠条被他人利用或产生不必要的纠纷。当然，在销毁原欠条之前，最好能够保留一份复印件或照片作为备份，以备不时之需。

从实际操作的角度

如果你选择在原欠条上写明已结清，那么一定要注意以下几点：

1. 修改规范：使用清晰、工整的字迹进行修改，确保修改的内容一目了然。可以在修改处加盖双方的手印或签字确认，以增加修改内容的可信度。
2. 明确信息：在修改时，要明确记载还款的具体时间、方式以及双方确认债务已经清偿等关键信息。例如，可以写上“于XXXX年XX月XX日，以XX方式（如现金、银行转账等）偿还全部债务，双方确认债务已经清偿”。
3. 保留证据：在修改欠条后，最好能够保留一份修改后的欠条复印件或照片作为备份。同时，如果可能的话，还可以让双方各自保留一份修改后的欠条原件或复印件。

建议：为了避免不必要的纠纷和风险，在欠条还清后，最好选择重新签订一份还款确认书或销毁原欠条的方式。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。