自己有刑事案底一般不会直接影响小舅子当民航飞行员，但可能存在间接影响，具体需分情况讨论：

1. 民航飞行员招录的直接审查标准
   根据民航局《民用航空背景调查规定》，招录飞行员时主要审查本人及直系亲属（父母、配偶、子女）的犯罪记录。小舅子属于旁系亲属，不在直接审查范围内。因此，若仅你本人有刑事案底，原则上不会直接导致小舅子背景调查不通过。

2. 间接影响的可能性

   • 家庭背景关联性审查：虽然旁系亲属不纳入直接审查，但部分航空公司可能扩大审查范围（如兄弟姐妹、配偶的兄弟姐妹），尤其涉及严重犯罪（如危害国家安全、恐怖活动等）时，可能因“家庭背景复杂性”影响招录单位对小舅子政治素质、社会关系的综合评估。
     
   • 招录单位自主权：航空公司有权根据岗位特殊性制定更高标准。若你曾因故意犯罪被判处刑罚，且招录单位认为你的案底可能间接反映小舅子家庭环境存在风险（如经济纠纷、社会关系复杂等），可能以“不符合岗位稳定性要求”为由拒绝录用。
     
   • 政审严格程度：若小舅子报考的是涉及国家安全的特殊航线（如国际航班、敏感区域航班），政审标准可能更严格，旁系亲属的犯罪记录可能被纳入考量范围。

3. 法律建议

   • 提前核实招录政策：建议小舅子直接咨询目标航空公司的招录部门，明确其背景调查的具体范围和标准（如是否审查旁系亲属、对犯罪记录的容忍度等）。
     
   • 如实披露信息：若招录单位明确要求披露旁系亲属犯罪记录，小舅子应如实说明情况，避免因隐瞒导致后续资格取消或法律责任。
     
   • 强调个人独立性：在申请材料中突出小舅子个人的品行、学业或工作表现，证明其与你的犯罪行为无关联，降低招录单位的顾虑。

总结：刑事案底对小舅子当飞行员的影响取决于招录单位的具体政策、案底性质及岗位特殊性。若你仅涉及普通刑事犯罪且招录单位未扩大审查范围，影响较小；但若涉及严重犯罪或招录单位标准严格，可能存在间接风险。建议小舅子根据目标单位要求提前准备，必要时可委托律师协助审核招录条件。如有进一步疑问，可直接向我咨询。