化妆品店发现过期医疗器械，一般由药品监督管理部门进行处罚。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法律依据与处罚主体：

   • 根据《医疗器械监督管理条例》的相关规定，医疗器械的经营、使用等环节均受到该条例的规范。化妆品店若经营医疗器械（包括但不限于销售、储存等），则需遵守该条例。
   • 当化妆品店发现过期医疗器械时，这属于违反医疗器械管理规定的行为。根据条例，药品监督管理部门是负责医疗器械监督管理的部门，因此有权对这类违法行为进行处罚。

2. 处罚措施与程序：

   • 药品监督管理部门在发现化妆品店存在过期医疗器械后，会依法进行调查取证，确认违法事实。
   • 根据违法情节的严重程度，药品监督管理部门可以采取多种处罚措施，如警告、罚款、没收违法所得、没收非法财物、责令停产停业、吊销许可证等。
   • 处罚程序通常包括立案、调查取证、审查决定、送达执行等环节，确保处罚的合法性和公正性。

3. 化妆品店的责任与应对：

   • 化妆品店作为医疗器械的经营者，有责任确保所经营的医疗器械符合安全、有效、合法的标准。发现过期医疗器械后，应立即停止销售，并主动向药品监督管理部门报告。
   • 化妆品店应积极配合药品监督管理部门的调查工作，提供必要的证据和资料，以便部门能够准确判断违法情节并作出相应的处罚决定。
   • 若化妆品店对处罚决定有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

4. 实际案例与启示：

   • 在实际执法过程中，药品监督管理部门曾多次对销售过期医疗器械的化妆品店进行处罚。这些案例表明，监管部门对医疗器械的安全管理非常重视，对违法行为将依法严惩。
   • 化妆品店应从中吸取教训，加强内部管理，定期检查库存医疗器械的有效期，确保所经营的医疗器械始终符合法规要求。

建议：化妆品店在日常经营中应严格遵守医疗器械管理规定，确保所经营的医疗器械安全、有效、合法。若发现过期医疗器械，应立即停止销售并主动报告药品监督管理部门，以避免不必要的法律风险和损失。如果您在医疗器械经营过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律意见和帮助。