针对您提出的“亲子鉴定后孩子户口父亲可以拒绝吗”这一问题，这实际上涉及到了法律、户籍管理以及亲子关系确认等多个层面。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，亲子鉴定是确认亲子关系的一种科学手段，但其结果并不直接决定孩子的户口问题。户口的登记和管理主要依据的是户籍管理法规和相关政策。

一、法律层面

1. 亲子关系的确认：根据《中华人民共和国民法典》及其相关司法解释，如果一方（如父亲）怀疑孩子并非其亲生，并提供了必要证据（如初步的亲子鉴定报告），而另一方（如母亲）没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定否认亲子关系一方的主张成立。但这主要是针对亲子关系的法律确认，并不直接涉及户口问题。

2. 精神损害赔偿：如果因亲子关系问题导致离婚，且无过错方（如父亲）因此遭受了精神损害，其有权请求损害赔偿。但这与户口问题无直接关联。

二、户籍管理层面

1. 非婚生育情况：对于非婚生育的孩子，如果出生证明上父亲信息错误或父亲不配合进行亲子鉴定，孩子通常可以跟随母亲落户。这是基于户籍管理的人性化考虑，确保孩子能够享有基本的户籍权益。

2. 落户手续：在办理落户手续时，母亲需要提供自己的身份证、户口本、孩子的出生证明等相关材料。如果出生证明上父亲信息有误或缺失，母亲需要向户籍管理部门说明情况，并可能需要提供其他证明材料（如亲子鉴定报告，如果已进行且结果明确）来辅助办理落户。

三、针对您问题的具体解答

• 如果亲子鉴定结果显示孩子并非父亲亲生，且父亲因此拒绝承认亲子关系，这并不影响孩子跟随母亲落户。母亲可以凭借自己的身份证、户口本和孩子的出生证明等材料，向户籍管理部门申请办理落户手续。
• 如果父亲拒绝配合进行亲子鉴定，且没有其他证据证明亲子关系，而母亲希望孩子跟随自己落户，她仍然可以按照上述非婚生育的情况办理落户手续。但需要注意的是，如果未来父亲提出异议并提供了相反证据，可能会引发法律纠纷和户籍变更等问题。

四、建议

• 在处理此类问题时，建议母亲先咨询当地的户籍管理部门或法律专业人士，了解具体的落户政策和法律程序。
• 如果可能的话，尽量通过协商或法律途径解决亲子关系问题，以避免对孩子造成不必要的伤害和影响。

综上所述，亲子鉴定后孩子户口父亲是否可以拒绝，并不直接影响孩子跟随母亲落户的权益。但具体办理落户手续时，还需要根据当地的户籍管理政策和相关法律法规进行操作。