结论：发现土地征收补偿权益被侵犯之后，若对政府组织的调解不满意，诉讼时效一般并非从调解时算起，而是从知道或者应当知道权益被侵犯之日起计算，但具体还需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
诉讼时效的起算点
一般规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 在土地征收补偿权益被侵犯的情境下，诉讼时效通常从被征收人知道或者应当知道其补偿权益被侵犯之日起计算，而非从调解时算起。调解只是解决争议的一种方式，它并不改变诉讼时效的起算点。
特殊情况：
- 如果在调解过程中，政府或相关部门明确承认了侵权行为，并给出了具体的赔偿方案或承诺，但被征收人对此不满意并决定提起诉讼，那么诉讼时效可能会从调解结束或政府明确拒绝赔偿之日起重新计算（若此前已知道权益被侵犯，则一般不重新计算）。但这种情况并非绝对，还需结合具体案情和法律规定来判断。
- 另外，如果被征收人在调解过程中一直不知道其权益被侵犯，直到调解结束后才发现，那么诉讼时效自然应从发现之日起计算。
调解对诉讼时效的影响
- 调解本身并不直接导致诉讼时效的中断或重新计算。诉讼时效的中断通常发生在权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务或权利人提起诉讼或申请仲裁等情形下。
- 如果在调解过程中，被征收人向政府或相关部门提出了明确的赔偿请求，并且政府或相关部门对此进行了回应（无论是同意还是拒绝），这可能构成诉讼时效中断的情形。但即便如此，诉讼时效也是从提出请求或得到回应之日起中断，而非从调解开始或结束之日起计算。
法律建议
及时主张权利：
- 一旦发现土地征收补偿权益被侵犯，被征收人应及时向政府或相关部门提出赔偿请求，并保留好相关证据（如征收公告、补偿协议、调解记录等）。
关注诉讼时效：
- 被征收人应密切关注诉讼时效的起算和中断情况，确保在诉讼时效期间内提起诉讼或申请仲裁。
寻求专业帮助：
- 如果对诉讼时效的计算或法律程序有疑问，被征收人应及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
举例说明：假设某被征收人在2020年1月发现其土地征收补偿权益被侵犯，但直到2023年6月才决定提起诉讼。如果在这期间没有发生诉讼时效中断的情形（如提出赔偿请求、政府同意赔偿等），那么该被征收人的诉讼时效可能已经过期。但如果该被征收人在2022年1月向政府提出了赔偿请求，并且政府在2022年3月明确拒绝了赔偿，那么诉讼时效可能从2022年3月起重新计算三年。
如有更多关于土地征收补偿权益被侵犯或诉讼时效的问题，可以直接向我咨询。