结论：上将违法后能否保留军籍，需根据违法行为的性质、情节严重程度以及相关法律法规的具体规定来综合判断。以下是一些可能的情况分析：
轻微违法行为：
- 如果上将的违法行为属于轻微范畴，如违反交通规则、轻微的行政违规等，且未造成严重后果或社会影响，那么根据军队内部的纪律处分规定，可能不会直接导致军籍的丧失。军队可能会根据具体情况，给予相应的行政处分或警告，但保留其军籍。
一般违法行为但情节较轻：
- 对于一些一般性的违法行为，如轻微的贪污、受贿但数额不大，或者违反军队纪律但情节较轻的，如果上将能够积极配合调查，主动退还违法所得，且没有造成严重的社会影响或军队内部的不良后果，那么也有可能保留军籍，但会受到相应的纪律处分，如降职、撤职等。
严重违法行为：
- 如果上将的违法行为构成犯罪，如贪污受贿数额巨大、严重违反军纪且造成恶劣影响等，那么根据《中华人民共和国刑法》以及军队的相关规定，其军籍将很可能被剥夺。此外，还可能面临刑事处罚，如有期徒刑、无期徒刑等。
特殊情况下的保留军籍：
- 在某些特殊情况下，如上将在执行任务过程中因不可抗力或紧急避险等原因导致违法行为，且事后能够积极补救、减轻后果的，军队可能会根据具体情况考虑保留其军籍。但这需要严格的审查和评估，且必须符合相关法律法规的规定。
法律背景与建议：
- 军籍是军人身份的重要标志，保留或剥夺军籍需严格依据法律法规进行。对于上将这样的高级军官，其违法行为的处理更是需要谨慎对待，既要维护军队的纪律和形象，又要保障其合法权益。
- 如果上将涉嫌违法，建议其积极配合调查，主动说明情况，争取从轻处理。同时，也可以寻求专业律师的帮助，了解自己的法律权益和可能的法律后果，以便做出更明智的决策。
可能的法律后果：
- 保留军籍的情况下，上将可能面临行政处分、降职、撤职等后果。
- 剥夺军籍的情况下，上将将失去军人身份，可能面临刑事处罚，且其未来的职业发展和生活都将受到严重影响。
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