针对您提出的问题，即“孩子跟我一个户口，我想在孩子的户籍所在地起诉，但孩子的户籍所在地不同意怎么办”，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，在民事诉讼中，管辖法院的确定通常遵循“原告就被告”的原则，也就是说，一般情况下，对公民提起的民事诉讼，应由被告住所地的人民法院管辖。如果被告住所地与经常居住地不一致，那么应由被告经常居住地的人民法院管辖。这里的“住所地”通常指的是公民的户籍所在地，而“经常居住地”则是指公民离开住所地至起诉时已连续居住一年以上的地方（住院就医的地方除外）。
然而，也存在一些特殊情况，使得原告可以在自己的住所地或者特定地点的人民法院提起诉讼。这些特殊情况包括但不限于：对不在中华人民共和国领域内居住的人、对下落不明或者宣告失踪的人、对被采取强制性教育措施的人、对被监禁的人提起的有关身份关系的诉讼等。但您的情况并不直接属于这些特殊情况。
现在，针对您想要在孩子户籍所在地（即您的户籍所在地，假设您与孩子户籍一致且该地非被告经常居住地）起诉的情况，如果孩子的户籍所在地（也即您想要起诉的法院所在地）并不是被告的住所地或经常居住地，且没有其他特殊法律规定允许在该地起诉，那么该法院可能会以没有管辖权为由不同意受理您的案件。
面对这种情况，您可以采取以下措施：
核实被告信息：首先，请确保您已经准确掌握了被告的住所地和经常居住地信息。这是确定管辖法院的关键。
咨询专业律师：由于法律问题具有复杂性和专业性，建议您咨询一位专业律师，以获取针对您具体情况的法律建议。律师可以帮助您分析案件，确定最有利的管辖法院，并指导您如何准备和提交诉讼材料。
考虑其他管辖法院：如果孩子的户籍所在地法院确实没有管辖权，您可以考虑向被告住所地或经常居住地的人民法院提起诉讼。如果被告是法人或其他组织，则应向其主要营业或主要办事机构所在地的人民法院提起诉讼。
提出管辖权异议的应对：如果被告在您选择的法院提起管辖权异议，您需要在收到异议通知后，准备相应的法律文件和证据来支持您的立场。这通常需要律师的协助。
遵循法律程序：无论您选择在哪个法院提起诉讼，都需要严格遵循法律程序，包括提交起诉状、证据材料、参加庭审等。
总之，面对管辖法院的问题，最重要的是准确掌握相关法律规定，并根据您的具体情况选择合适的诉讼策略。希望这些建议能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。