履约保函纸质版丢失后，应立即采取以下措施以降低风险并保障自身权益：

1. 第一时间联系出具保函的银行或金融机构
   立即致电或前往开具保函的银行，说明保函丢失的情况，并按照银行要求提交书面挂失申请。银行通常会要求提供保函编号、合同信息、丢失经过等材料，并可能要求补办公告或声明（如登报声明作废）。此步骤的目的是防止保函被他人冒用，避免潜在的经济损失。

2. 确认保函是否可补办或出具副本
   根据银行政策，部分保函可补办原件或出具加盖公章的副本，效力与原件一致。若银行允许补办，需配合提供合同、身份证明等材料，并支付可能的工本费。若无法补办，可要求银行出具书面证明，说明保函已丢失且原保函作废，作为后续争议的证据。

3. 通知合同相对方（如业主、承包方等）
   及时书面告知对方保函丢失的情况，并附上银行的挂失证明或作废声明。此举可避免对方因保函“失效”而主张违约责任，同时为后续协商解决方案（如重新开具保函、提供其他担保）奠定基础。

4. 评估是否需要重新开具保函
   若合同明确要求保函为“原件”且未约定丢失后的替代方案，可能需与对方协商重新开具保函。此时需注意：

   • 重新开具的费用（如银行手续费）通常由丢失方承担；
     
   • 若原保函已部分履行（如工程已完工），可尝试与对方协商免除或降低保函金额。

5. 防范法律风险：保留证据链
   保存所有与保函丢失相关的沟通记录（如邮件、短信、录音）、银行挂失证明、登报声明等材料，形成完整的证据链。若后续因保函丢失引发纠纷（如对方主张索赔），这些证据可证明你已尽到合理注意义务，避免被认定为“故意丢失”或“重大过失”。

补充建议：

• 若保函涉及国际工程或跨境交易，需特别注意银行保函的适用法律（如《见索即付保函统一规则》URDG）及国际惯例，部分情况下可能需通过SWIFT系统挂失。
  
• 未来可考虑将保函扫描为电子版并加密存储，同时要求银行提供“电子保函”服务（如通过区块链技术存证），降低丢失风险。
  

如有进一步疑问（如具体操作流程、合同条款解读），可直接向我咨询，我会结合保函类型、合同约定及适用法律为你详细分析。