商标侵权赔偿款的归属需根据具体情况确定，主要归商标注册人或其合法的权利继受人所有，但在存在商标使用许可合同的情况下，赔偿款的分配需依据合同条款及实际损失进行。以下是对这一问题的详细分析：
商标注册人所有情况
- 一般情况下，商标侵权赔偿款归商标注册人所有。商标注册人作为商标的专用权主体，因他人侵权行为遭受的经济损失（如销售业绩下滑、品牌声誉受损等）及为调查和制止侵权行为所支出的合理费用，均应通过赔偿款得到弥补。例如，若A公司是某商标的注册人，B公司未经许可在类似商品上使用该商标并导致A公司产品销量下降，A公司胜诉后获得的侵权赔偿款应归其所有。
根据商标使用许可合同确定情况
- 独占使用许可：在独占使用许可合同中，被许可人在约定时间和地域范围内对商标享有独占使用权。此时，若发生商标侵权，被许可人可单独提起诉讼，获得的赔偿款通常归其所有，因为侵权行为主要损害的是被许可人的利益。
- 排他使用许可：在排他使用许可中，商标注册人与被许可人均可在约定范围和时间内使用商标。若发生侵权，双方可共同起诉或由被许可人自行起诉（商标注册人不起诉时）。赔偿款应根据合同约定分配；若无约定，则可能根据双方实际损失等因素合理分配。
- 普通使用许可：在普通使用许可中，商标注册人可许可多个被许可人使用商标。被许可人经明确授权后可提起诉讼。赔偿款归属先看合同约定；若无约定，则主要归商标注册人所有，但被许可人因侵权遭受的实际损失部分也可能获得相应补偿。
商标权转让、继承等情况
- 商标权转让：若侵权行为发生后、赔偿款确定前商标权已转让，则赔偿款一般归受让方所有。因为受让方已继受商标的相关权利和义务，侵权行为对其造成了损害。
- 商标权继承：当商标注册人死亡或终止后，其商标专用权按继承法规定继承。此时，因商标侵权获得的赔偿款归继承该商标权的继承人所有。
法律建议：
- 对于商标注册人而言，应密切关注商标的使用情况，一旦发现侵权行为，及时收集证据并提起诉讼，以维护自身合法权益。
- 对于商标被许可人而言，在签订商标使用许可合同时，应明确约定赔偿款的归属及分配方式，以避免后续纠纷。
- 在商标权转让或继承过程中，应确保相关手续的合法性和有效性，以便在发生侵权行为时能够顺利主张赔偿款。
可能后果：
- 若商标侵权赔偿款归属问题处理不当，可能导致商标注册人或被许可人遭受经济损失，甚至影响商标的声誉和市场价值。
- 在商标使用许可合同中未明确约定赔偿款归属的情况下，双方可能因赔偿款分配问题产生纠纷，影响合作关系的稳定。
如有任何关于商标侵权赔偿款归属的具体问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。