案件结束后被告人的手机处理方式需根据手机是否属于涉案财物、是否与案件事实有关以及案件的具体性质来综合判断，具体如下：

1. 若手机属于涉案财物且与案件事实直接相关：

   • 在案件审理过程中，手机可能已被公安机关依法扣押作为证据使用。
   • 案件结束后，若手机被认定为涉案财物且需要作为证据留存，法院或公安机关可能会继续保管手机，直至其证据价值消失或根据法律程序进行销毁。
   • 若手机不再需要作为证据，且其所有权明确属于被告人，法院或公安机关应当及时返还给被告人。

2. 若手机不属于涉案财物或与案件事实无直接关联：

   • 在案件审理过程中，若手机未被扣押或虽被扣押但经审查与案件事实无直接关联，被告人或其家属有权要求返还手机。
   • 案件结束后，无论手机是否被扣押，只要其不属于涉案财物或与案件事实无直接关联，且所有权明确属于被告人，法院或公安机关均应返还给被告人。

3. 特殊情况下的处理：

   • 若手机涉及国家秘密、个人隐私或商业秘密等敏感信息，且其返还可能对国家安全、公共利益或他人合法权益造成损害，法院或公安机关可能会根据法律规定采取相应的保密措施或不予返还。
   • 若手机被用于实施犯罪行为，如作为犯罪工具，且其返还可能引发新的犯罪或危害社会安全，法院或公安机关可能会依法予以没收或销毁。

在处理过程中，被告人或其家属应注意以下几点：

• 保留好手机的购买凭证、所有权证明等相关文件，以便在要求返还时提供证据。
• 若对手机的处理有异议，可以及时向法院或公安机关提出申诉或复议申请。
• 在整个处理过程中，应积极配合法院或公安机关的工作，遵守相关法律法规和程序规定。