结论：是否配合违建调查，需根据具体情况判断，但一般建议配合，以下从不同角度为你详细分析。

一、从法律义务角度

配合行政机关的调查是公民的法定义务。根据相关法律法规，行政机关有权对涉嫌违法建设的行为进行调查取证。作为公民或相关责任人，有义务提供必要的协助，如提供相关证件、说明情况等。如果不配合调查，可能会面临行政机关的强制措施，如强制传唤、查封现场等，甚至可能因阻碍执法而受到行政处罚，如罚款、拘留等。

举例：假设你拥有一处房产，被邻居举报存在违建情况。行政机关前来调查时，你拒绝配合，不提供房产证、规划许可证等相关证件，也不允许执法人员进入现场查看。这种情况下，行政机关可能会采取强制措施，如破门而入进行调查，或者对你进行罚款、拘留等处罚。

二、从实际后果角度

1. 若违建事实存在：配合调查可以主动说明情况，争取从轻处理。在调查过程中，你可以向行政机关解释违建的原因、过程以及目前的状况等，行政机关会根据实际情况和相关法律法规进行裁量。如果态度诚恳、配合积极，可能会在处罚上给予一定的减轻或从宽处理。 举例：你因家庭居住需要，在未经规划许可的情况下搭建了一间小屋。在配合调查时，你如实说明了情况，并表示愿意按照要求进行整改。行政机关可能会根据你的态度和实际情况，给予你一定的整改期限，并适当减轻罚款金额。
2. 若违建事实不存在或存在争议：配合调查可以及时澄清事实，避免不必要的麻烦。通过提供相关证据和说明情况，行政机关可以更准确地判断是否存在违建行为，从而避免误判和错误处罚。 举例：你家的房产结构被邻居误解为违建，实际上是完全符合规划要求的。在配合调查时，你提供了房产证、规划许可证等相关证件，并带领执法人员对房产进行了实地查看。行政机关在核实情况后，会确认不存在违建行为，从而避免了对你的错误处罚。

三、从法律程序角度

配合调查是法律程序的重要环节。行政机关在调查违建行为时，需要遵循一定的法律程序，包括调查取证、听取陈述申辩、作出行政处罚决定等。作为当事人，你有权参与这些程序，并表达自己的意见和诉求。如果不配合调查，可能会影响法律程序的正常进行，导致你的合法权益无法得到充分保障。

建议：在面对违建调查时，建议你保持冷静和理性，积极配合行政机关的调查工作。如果对调查过程或结果有异议，可以在法律规定的期限内提出陈述申辩或申请行政复议、提起行政诉讼等法律救济途径来维护自己的合法权益。

如果你在违建配合调查方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。