外商投资企业的设立与变更主要由市场监督管理部门（原工商行政管理部门）负责，但根据具体事项的不同，还可能涉及商务部门、外汇管理部门、发改委等多个部门。以下是详细说明：

1. 市场监督管理部门：

   • 设立登记：外商投资企业设立时，需向市场监督管理部门提交相关材料，包括公司章程、投资者身份证明、投资协议等，以完成企业注册登记，领取营业执照。
   • 变更登记：当外商投资企业发生名称、住所、法定代表人、注册资本、经营范围等变更时，也需向市场监督管理部门申请变更登记，更新企业信息。

2. 商务部门：

   • 外资准入管理：在设立外商投资企业前，需根据《外商投资准入特别管理措施（负面清单）》等规定，向商务部门或其授权的地方商务主管部门咨询并确认投资领域是否受限，以及是否需要获得特别审批。
   • 合同、章程审批：对于某些特定类型的外商投资企业，如中外合资经营企业、中外合作经营企业，其合同、章程可能需报商务部门审批。

3. 外汇管理部门：

   • 外汇登记：外商投资企业设立后，需向外汇管理部门办理外汇登记手续，以便进行跨境资金收付和结售汇等业务。
   • 资本项目外汇管理：对于外商投资企业的资本金结汇、利润汇出等资本项目外汇业务，也需遵守外汇管理部门的相关规定。

4. 发改委：

   • 项目核准/备案：对于某些大型或特定类型的外商投资项目，可能需报国家或地方发改委进行项目核准或备案，以确保项目符合国家产业政策和发展规划。

5. 其他相关部门：

   • 根据外商投资企业的具体业务和行业特点，还可能涉及环保、税务、海关、质检等多个部门的管理和审批。

建议：在设立或变更外商投资企业时，建议企业提前了解并咨询相关部门的政策和要求，确保各项手续齐全、合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。