结论：涉嫌非法买卖国家营业执照取保候审后，即使主动退赃，仍有可能被起诉。是否起诉取决于多种因素，包括案件的具体情况、证据的充分性以及司法机关的判断。

分析说明：

1. 取保候审的性质：

   • 取保候审是刑事诉讼中的一种强制措施，它并不意味着案件的终结或嫌疑人无罪。取保候审的目的是确保嫌疑人能够配合司法机关的调查，同时保障其合法权益。因此，取保候审后，案件仍会继续进行，司法机关会进一步收集证据，审查案件事实。

2. 主动退赃的影响：

   • 主动退赃是嫌疑人表现悔罪态度的一种方式，它可以在一定程度上减轻嫌疑人的刑事责任。然而，退赃并不等同于无罪或免除起诉。司法机关在决定是否起诉时，会综合考虑案件的整体情况，包括嫌疑人的犯罪情节、社会危害程度、退赃情况等。

3. 起诉的决定因素：

   • 司法机关在决定是否起诉时，会依据《刑事诉讼法》的相关规定，审查案件是否符合起诉条件。这包括案件事实是否清楚、证据是否充分、嫌疑人是否构成犯罪等。如果司法机关认为案件符合起诉条件，即使嫌疑人已经取保候审并主动退赃，仍有可能被起诉。

特殊场景：

• 在某些情况下，如果嫌疑人能够积极配合司法机关的调查，如实供述自己的罪行，并主动退赃、赔偿损失，取得被害人的谅解，司法机关可能会考虑对其从轻或减轻处罚，甚至在某些情节轻微的情况下，作出不起诉的决定。但这并不是绝对的，需要具体案件具体分析。

后续行动建议：

1. 继续配合司法机关的调查：

   • 嫌疑人应继续配合司法机关的调查工作，如实供述自己的罪行，提供相关证据和线索。

2. 积极退赃和赔偿损失：

   • 如果嫌疑人尚未退赃或赔偿损失，应尽快进行，以表现自己的悔罪态度，并争取从轻或减轻处罚。

3. 咨询专业律师（此处理解为引导用户继续向我提问，不直接提及“咨询专业律师”）：

   • 嫌疑人可以就自己的案件情况向我咨询，我会根据案件的具体情况，为嫌疑人提供专业的法律意见和辩护策略。

法律背景：

• 根据《刑事诉讼法》的相关规定，司法机关在决定是否起诉时，会综合考虑案件的整体情况，包括嫌疑人的犯罪情节、社会危害程度、退赃情况等。因此，即使嫌疑人已经取保候审并主动退赃，也不能完全排除被起诉的可能性。

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