土地承包经营权证上基本农田与非基本农田的主要区别体现在定义与划定、保护程度、用途管制以及征收补偿等多个方面。以下是对这些区别的详细阐述：

1. 定义与划定：

   • 基本农田：是依据土地利用总体规划，为满足一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求而划定的不得占用的耕地。它通常具备高产、稳产、优质的特点，且集中连片程度较高，是保障国家粮食安全的重要基石。
   • 非基本农田：则是指除基本农田以外的其他耕地，其土地质量、生产能力等方面可能相对基本农田存在一定差距。非基本农田的划定没有像基本农田那样严格的标准和特定的限制条件，更多是基于土地的现状用途及一般的农业生产条件来认定。

2. 保护程度：

   • 基本农田：受到最为严格的保护。国家对基本农田实行特殊保护制度，严禁任何单位和个人进行破坏活动，如建窑、建房、挖砂、采矿等。基本农田的转用审批极为严格，一般只有国家重点建设项目选址无法避开时，才可经过国务院批准后依法办理审批手续。
   • 非基本农田：虽然也受到法律保护，但保护力度相对较弱。在符合土地利用总体规划和相关法律法规的前提下，非基本农田的用途变更相对灵活，审批程序没有那么严格。

3. 用途管制：

   • 基本农田：用途被严格限定为主要用于粮食等重要农产品的生产。即使是农业结构调整，也不得破坏耕作层和农业生产条件，不得改变其农业用途。
   • 非基本农田：在用途上有一定的弹性空间。除了传统粮食种植外，还可以根据市场需求进行特色农业、设施农业等经营活动。但仍需遵守相关土地管理规定，如需转化为建设用地或其他用途，需经过相关部门的审批和备案程序。

4. 征收补偿：

   • 基本农田：征收补偿标准通常较高。因其生产能力强，对保障国家粮食安全具有重要意义。补偿费用涵盖土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费等多个项目，且按当地较高水平执行。
   • 非基本农田：征收补偿标准相对较低。具体补偿标准根据当地经济发展水平、土地市场价值等因素调整。但仍需按照土地管理法等相关法律法规来确定补偿费用。

实际应用中的注意事项：

• 对于农民而言，在承包土地时，应明确了解土地的性质与用途，特别是要确认是否属于基本农田。这可以通过咨询当地相关部门或查询相关文件、公告来实现。
• 如果承包的土地属于基本农田，那么在使用时应严格遵守相关法律法规和规划要求，不得擅自改变其农业用途或进行破坏活动。
• 如果承包的土地属于非基本农田，虽然在使用上相对灵活，但仍需遵守相关土地管理规定，确保土地资源的合理利用和保护。

总结：

土地承包经营权证上基本农田与非基本农田的区别主要体现在定义与划定、保护程度、用途管制以及征收补偿等多个方面。基本农田作为国家粮食安全的重要保障，受到更为严格的保护和管理；而非基本农田则在使用和转化上相对灵活，但仍需遵守相关法律法规和规划要求。农民在承包土地时，应明确了解土地的性质与用途，以确保合规使用并发挥土地的最大效益。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。