公司收取发薪服务费一般是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
根据《中华人民共和国劳动法》以及《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。发薪服务费并非法定的工资支付项目，公司以此为由收取费用，实际上是对劳动者工资的克扣，违反了上述法律规定。
实际操作角度
合同约定情况：
- 如果劳动合同中明确约定了公司可以收取发薪服务费，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么从合同约定的角度来看，公司似乎有权收取。但即便如此，这种约定也可能因违反公平原则或损害劳动者权益而被认定为无效。因为工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，公司不应通过合同条款将本应由其承担的成本转嫁给劳动者。
- 如果劳动合同中没有约定公司可以收取发薪服务费，那么公司擅自收取就是违法的，劳动者有权拒绝支付，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
费用性质与合理性：
- 发薪服务费如果被视为公司为劳动者提供工资发放服务而收取的费用，那么这种费用在本质上是不合理的。因为工资发放是公司的基本义务之一，公司不应因此向劳动者收取额外费用。
- 如果公司声称发薪服务费是用于支付第三方服务机构的费用（如银行手续费等），那么这种费用也应由公司自行承担，或者通过合法途径与劳动者协商分担，而不是擅自扣除劳动者的工资。
劳动者应对建议
与公司协商：
- 如果公司提出收取发薪服务费，劳动者可以先与公司进行协商，了解公司收取该费用的具体原因和依据，并表达自己的异议和诉求。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，反映公司收取发薪服务费的情况，并要求劳动监察部门进行调查和处理。
申请劳动仲裁：
- 如果劳动监察部门未能解决问题，或者劳动者对劳动监察部门的处理结果不满意，还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，公司收取发薪服务费一般是不合法的。劳动者在遇到这种情况时，应积极维护自己的权益，通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等方式来解决问题。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。