当两个不同的行政机关作为被告被起诉至同一法院时，法院会按照以下方式处理：

1. 确定管辖与受理：

   • 法院首先会审查案件是否属于其管辖范围，包括地域管辖和级别管辖。只要案件属于该法院的管辖范围，且符合起诉条件（如原告与案件有直接利害关系、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由等），法院就会受理案件。
   • 在此情况下，两个行政机关作为共同被告，并不影响法院对案件的受理。法院会将其视为一个案件进行审理，而不是分别受理。

2. 审理程序：

   • 法院在受理案件后，会按照法定程序进行审理。这包括送达起诉状副本给被告（即两个行政机关），要求它们在规定期限内提交答辩状和相关证据。
   • 审理过程中，法院会组织双方进行证据交换、质证，并可能进行庭审辩论。两个行政机关作为共同被告，需要共同应对原告的诉讼请求，并可以就案件事实、法律适用等问题进行辩论。

3. 判决与执行：

   • 法院在审理结束后，会根据查明的事实和适用的法律，作出判决。判决可能涉及对两个行政机关的共同责任认定，也可能分别确定它们各自的责任。
   • 如果判决涉及两个行政机关的共同责任，且它们未履行判决义务，原告可以申请法院强制执行。在执行过程中，法院可能会根据具体情况，对两个行政机关的财产进行查封、扣押、拍卖等措施，以保障原告的合法权益。

4. 特殊情况处理：

   • 如果两个行政机关在案件中的责任难以区分，或者存在其他复杂情况，法院可能会要求它们先进行内部协调或行政复议，以明确各自的责任和义务。但这并不影响法院对案件的审理和判决。
   • 另外，如果两个行政机关对法院的判决有异议，它们可以在法定期限内提起上诉或申请再审。但在此之前，它们必须履行法院的判决义务，除非法院依法裁定中止执行。

法律建议：

• 对于原告而言，在起诉两个行政机关时，应确保起诉状中明确列出两个被告，并详细阐述它们的违法行为和应承担的责任。同时，原告应积极收集证据，以支持自己的诉讼请求。
• 对于两个行政机关而言，作为共同被告，它们应积极配合法院的审理工作，提交答辩状和相关证据，并参与庭审辩论。如果它们认为法院的判决有误，可以在法定期限内提起上诉或申请再审。

可能后果：

• 如果法院判决两个行政机关共同承担责任，且它们未履行判决义务，原告可以申请法院强制执行。这可能导致两个行政机关的财产被查封、扣押或拍卖，以保障原告的合法权益。
• 如果两个行政机关对法院的判决有异议并提起上诉或申请再审，案件可能会进入二审或再审程序。这将延长案件的审理时间，并可能增加当事人的诉讼成本。

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