关于取保候审保证金2000元和5000元的区别，这主要取决于多个因素的综合考量，而非一个固定的差额标准。以下是对这一问题的详细解答：
首先，我们需要明确的是，取保候审保证金的数额并不是随意设定的，而是根据一系列因素来综合确定的。这些因素包括但不限于：犯罪嫌疑人或被告人的社会危险性、案件的情节和性质、可能判处刑罚的轻重、犯罪嫌疑人或被告人的经济状况，以及当地的经济发展水平等。
社会危险性：如果犯罪嫌疑人或被告人的社会危险性较高，即他们可能对社会造成更大的危害，那么为了保证其不逃避或妨碍刑事诉讼活动，可能需要收取更高的保证金。
案件情节和性质：案件的严重程度、是否涉及暴力犯罪、是否有多人受害等因素也会影响保证金的数额。一般来说，案件越严重，保证金可能越高。
可能判处刑罚的轻重：如果犯罪嫌疑人或被告人可能面临较重的刑罚，那么为了确保其能够配合司法程序，可能需要收取更高的保证金作为约束。
经济状况：犯罪嫌疑人或被告人的经济状况也是考虑因素之一。如果其经济状况较好，那么收取较高的保证金可能更为合适；反之，如果经济状况较差，则可能收取较低的保证金。
当地经济发展水平：不同地区的经济发展水平不同，这也会影响保证金的数额。一般来说，经济发达地区的保证金数额可能相对较高。
具体到2000元和5000元的区别，这很可能是基于上述因素的综合考量后得出的结果。例如，在某些案件中，犯罪嫌疑人或被告人的社会危险性相对较低，案件情节较轻，可能判处刑罚也较轻，同时其经济状况一般，且当地经济发展水平适中，那么可能收取2000元的保证金。而在另一些案件中，如果犯罪嫌疑人或被告人的社会危险性较高，案件情节严重，可能判处刑罚较重，同时其经济状况较好，且当地经济发展水平较高，那么可能收取5000元或更高的保证金。
此外，还需要注意的是，保证金的数额并不是一成不变的。在取保候审期间，如果犯罪嫌疑人或被告人遵守了相关规定，没有逃避或妨碍刑事诉讼活动，那么在取保候审结束时，保证金应当退还。反之，如果违反了相关规定，保证金可能会被没收，并且还可能面临其他法律后果。
综上所述，取保候审保证金2000元和5000元的区别主要取决于犯罪嫌疑人或被告人的具体情况以及案件的相关因素。在确定保证金数额时，司法机关会综合考虑多个因素，以确保保证金的数额既能够约束犯罪嫌疑人或被告人不逃避或妨碍刑事诉讼活动，又不会对其造成过大的经济负担。