政府部门节假日值班通常算加班，且应依法支付加班工资。以下从不同角度为你详细分析：
法律依据角度
根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
- 法定节假日安排劳动者工作的：支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。政府部门在节假日安排员工值班，属于在法定节假日安排工作，因此应当按照这一标准支付加班工资。
实际情况与操作角度
值班与加班的区分：
- 在实际操作中，有时会将“值班”与“加班”进行区分。但一般来说，如果值班期间员工需要履行与正常工作期间相似的职责，或者需要保持高度警惕以应对可能发生的工作任务，那么这种值班就应当被视为加班。
- 政府部门在节假日的值班，往往涉及到公共安全、社会秩序等重要职责，值班人员需要随时准备应对各种突发情况，因此这种值班应当被视为加班。
加班工资的支付：
- 既然政府部门节假日值班属于加班，那么根据《劳动法》的规定，就应当支付加班工资。具体来说，就是按照员工正常工资的百分之三百来支付。
- 如果政府部门未能依法支付加班工资，员工有权向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
特殊情况与注意事项
- 调休与补休：在某些情况下，政府部门可能会通过调休或补休的方式来安排员工的工作时间，以避免支付加班工资。但需要注意的是，法定节假日的加班是不能通过调休或补休来替代的，必须依法支付加班工资。
- 合同与规定：如果政府部门与员工之间有特别的合同或规定，明确了节假日值班的待遇和支付方式，那么应当按照合同或规定来执行。但合同或规定的内容不得违反《劳动法》等法律法规的强制性规定。
建议：如果你作为政府部门的员工，在节假日被安排值班，但未能获得相应的加班工资，你可以先与部门进行沟通协商，要求依法支付加班工资。如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，或者通过法律途径来维护自己的合法权益。
总结：政府部门节假日值班通常算加班，且应依法支付加班工资。这是基于《劳动法》的明确规定，也是保障员工合法权益的重要体现。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。