可以申请执行，但执行过程中需考虑农作物生长周期及合理处置方式，具体分析如下：

1. 终审判决的效力
   根据《民事诉讼法》第171条，二审判决为终审判决，自作出之日起生效。这意味着判决具有强制执行力，无论土地上是否存在农作物，胜诉方均有权向法院申请强制执行。执行法院不得以“存在农作物”为由拒绝受理执行申请。

2. 执行标的的特殊性处理
   土地上的农作物属于附着物，其处置需遵循《民法典》第322条关于“添附”的规定。执行时需区分两种情形：

   • 若农作物为被执行人所有：法院可依法拍卖、变卖土地及农作物，或要求被执行人自行收割后交付土地。若被执行人拒不收割，法院可委托第三方代为处理，费用由被执行人承担。
     
   • 若农作物为案外人所有（如承租人种植）：需通过执行异议之诉确认权属。若案外人能证明其合法占有（如租赁合同），法院可能暂缓执行或要求申请人提供担保后继续执行，但最终以权属判决为准。

3. 执行程序的合理性保障
   根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第12条，执行土地时，法院应保留被执行人及其所扶养家属的生活必需费用。若农作物为被执行人主要生活来源，法院可能允许其在合理期限内收割后再交付土地，但期限一般不超过判决确定的履行期。

4. 实务建议

   • 申请执行时：需提交生效判决书、执行申请书及土地权属证明，明确要求“交付土地”或“清除地上物”。
     
   • 执行过程中：若遇被执行人阻挠，可要求法院采取强制清场措施；若涉及案外人权益，及时提出执行异议。
     
   • 农作物处置：建议与被执行人协商收割时间，避免因强制执行导致农作物毁损引发赔偿纠纷。

总结：终审判决后，您有权申请强制执行土地交付，但需通过合法程序处置农作物。若遇复杂情况（如案外人主张权利），建议委托律师协助制定执行方案，确保权益实现。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。