在法院开庭时，若刑事案件的被告人缺席，法院会根据具体情形作出相应的处理。以下是对这一问题的详细解答：

一、被告人自行缺席的处理

1. 传唤与到庭：

   • 法院会依法向被告人送达传票，要求其按时出庭。
   • 若被告人经传唤后仍不到庭，法院会根据案件的具体情况，考虑是否需要采取强制措施强制其到庭。对于应当逮捕而在逃的被告人，法院必要时会发布通缉令，并采取有效措施将其追捕归案。

2. 特殊情况处理：

   • 若被告人患有严重疾病无法出庭，且这一状况导致案件长时间无法继续审理，法院会裁定中止审理。待被告人病情好转，能够出庭时，再恢复审理。

二、被告人委托辩护人出庭但自己缺席的处理

1. 辩护人参与审理：

   • 在查明被告人确实因客观原因（如疾病、不可抗力等）无法到庭的情况下，法院会在辩护人的参与下继续审理案件。
   • 法院会充分考虑被告人缺席对其辩护权利行使的影响，并在裁判文书中予以说明，确保被告人的合法权益得到保障。

2. 证据审查与判决：

   • 法院会依法审查检察院出示的证据，听取辩护人的辩护意见，并根据案件事实和法律规定作出判决。

三、特定类型案件的缺席审判

对于贪污贿赂、严重危害国家安全、恐怖活动犯罪等特定类型的案件，如果被告人在境外，且检察院认为犯罪事实清楚、证据确实充分，可以向法院提起公诉。法院在审查符合条件后，会决定开庭审判，并根据案件情况作出缺席判决。

四、缺席判决的法律效力与后续措施

1. 法律效力：

   • 无论被告人是否出席庭审，法院的判决均具有法律效力。被告人必须履行判决所确定的义务，否则将承担相应的法律后果。

2. 后续措施：

   • 如果被告人不服判决，可以在规定时间内提出上诉或申请再审。
   • 如果被告人不履行判决所确定的义务，胜诉方可以向法院申请强制执行，法院会采取一系列措施确保判决得到履行，包括但不限于冻结银行账户、查封财产等。

五、建议与注意事项

• 被告人应充分认识到出席庭审的重要性：缺席庭审将视为放弃答辩、质证等诉讼权利，并可能承担由此产生的不利后果。
• 尊重法律程序：被告人应尊重法院的判决和法律程序，积极履行自己的法律义务。即使缺席，也不能逃避应承担的法律责任。
• 提前沟通：如果有特殊情况不能出庭，被告人应提前与法院沟通，申请延期开庭或其他解决方式，以避免不必要的法律后果。

综上所述，刑事案件中被告人缺席时，法院会根据具体情形作出相应的处理。被告人应充分认识到出席庭审的重要性，并尊重法律程序，以维护自己的合法权益。