关于通过汇同清算软件退费是否合法的问题，结论需分情况讨论：

1. 若汇同清算软件本身合法且退费流程合规
   若该软件系依法设立的清算机构或第三方支付平台开发，退费流程符合《民法典》合同编中关于合同解除、违约责任的规定（如第562条、第577条），且未违反《电子商务法》《消费者权益保护法》中关于资金清算、消费者知情权的规定，则通过该软件退费是合法的。
   例如：租赁合同双方协商一致解除合同，出租方通过汇同清算软件按约定退还押金，流程透明且无额外扣费，此行为合法。

2. 若汇同清算软件存在以下情形，则退费可能违法

   • 软件未取得合法资质：若该软件未获得支付业务许可证或清算业务许可，擅自处理资金清算，可能违反《非银行支付机构网络支付业务管理办法》及《非法金融机构和非法金融业务活动取缔办法》，导致退费行为无效。
     
   • 退费流程侵犯权益：若软件在退费时强制扣除不合理费用（如“手续费”“服务费”），或未明确告知退费规则，可能违反《消费者权益保护法》第26条（经营者不得以格式条款加重消费者责任）及第55条（欺诈赔偿）。
     
   • 软件被用于非法目的：若退费行为涉及洗钱、诈骗等违法活动（如虚构租赁合同骗取退款），则不仅退费行为违法，参与者还可能承担刑事责任。

3. 租赁合同纠纷中的退费合法性核心要点

   • 合同约定优先：若租赁合同明确约定了退费条件、流程及责任方（如“合同提前解除时，押金应在7个工作日内无息退还”），则双方应按约定执行，软件仅作为工具，不影响合同效力。
     
   • 法定退费情形：若合同未约定或约定不明，根据《民法典》第733条（租赁期限届满，承租人返还租赁物后，出租人应返还押金）及第566条（合同解除后，尚未履行的终止履行，已履行的可请求恢复原状或赔偿损失），出租方无正当理由拒绝退费或通过软件设置障碍，可能构成违约。

建议：

• 若您是承租方，退费前应要求出租方通过书面或可追溯的方式（如邮件、短信）确认退费金额及时间，并保留租赁合同、付款凭证等证据；若遇软件扣费或拒退，可向当地市场监管部门投诉或通过诉讼主张权利。
  
• 若您是出租方，应确保退费流程符合合同约定及法律规定，避免因软件操作不当引发纠纷；若承租方恶意退费（如虚构损失），可要求其提供证据或通过法律途径追责。
  

如有具体案情或合同条款需要分析，可直接向我咨询，我会结合细节进一步解答。