在解答您关于“变更法人股东是否需要法人数字证书”的问题时，我们首先要明确的是，这一流程的具体要求可能因地区和具体政策而异，但我可以根据一般情况和您提供的参考信息，给出一个较为全面的解答。
一般情况分析：
在大多数情况下，当公司进行法人股东变更时，为了确保变更的合法性和有效性，通常需要使用到相关的数字证书或电子签名来验证身份和授权。数字证书在这里起到了身份认证和电子签名的作用，是确保交易安全、防止欺诈的重要手段。
针对您提供的参考信息分析：
从深圳市市场监督管理局的答复中，我们可以了解到，当其他企业作为该公司的股东时，其股东企业签名需使用该股东企业自己的组织机构证书签名，而不能由股东企业的法人代签。这说明了在企业作为股东的情况下，需要使用企业自身的数字证书（如组织机构证书）来进行签名和验证。
虽然您提到的第一个参考信息中并未直接回答是否需要法人数字证书，但它提到了“变更股东的数字证书”和“法人扫脸代替”的询问，这暗示了数字证书在股东变更过程中的重要性，以及可能存在的替代验证方式（如扫脸，但具体是否可行需根据当地政策确定）。
综合解答：
是否需要法人数字证书：在法人股东变更的过程中，通常需要使用到数字证书来验证身份和授权。如果是企业作为股东，那么需要使用该企业自身的数字证书（如组织机构证书）进行签名。如果是自然人作为股东，则可能需要使用个人的数字证书或进行其他形式的身份验证。
特殊情况：虽然数字证书是常见的验证方式，但具体政策可能因地区而异，且可能存在其他替代的验证方式（如扫脸、短信验证等）。因此，在进行法人股东变更前，建议您先咨询当地的市场监督管理局或相关机构，了解具体的政策要求和操作流程。
建议：为了确保变更的顺利进行，建议您提前准备好所有必要的材料和数字证书，并了解清楚当地的政策要求和操作流程。如果有任何疑问或不确定的地方，可以及时向相关部门或专业人士咨询。
综上所述，变更法人股东时通常需要使用到数字证书进行身份验证和授权，但具体要求可能因地区和政策而异。因此，在进行变更前，请务必咨询当地的市场监督管理局或相关机构以获取准确的信息和指导。