合同中部分有效部分无效，意味着合同中的某些条款因违反法律、行政法规的强制性规定，或存在其他无效情形而不具有法律效力，但这并不影响合同其余部分的效力及整体成立。以下是对这一问题的详细分析：
一、区分有效与无效部分
有效部分：合同中未违反法律法规强制性规定、未违背公序良俗、不存在欺诈胁迫等法定情形的条款，视为有效。例如，符合法律规定的租金条款、租赁期限条款、付款方式条款等，这些条款对双方当事人具有法律约束力，双方应按照约定全面履行自己的义务。
无效部分：违反法律法规强制性规定、违背公序良俗、存在欺诈胁迫损害国家利益等情形的条款，视为无效。如显失公平的违约金条款、违法的技术转让条款、恶意串通损害他人利益的条款等。这些条款自始不具有法律约束力，双方无需履行这些条款所规定的义务。
二、无效部分的处理
返还财产：若无效部分涉及财产给付，取得财产的一方应返还给对方。无法原物返还的，应折价补偿。例如，基于无效交易条款收取的预付款需返还，若财产已无法返还（如灭失或被第三人合法取得），则应根据市场价值或其他合理标准折价补偿。
赔偿损失：有过错的一方应赔偿对方因此受到的损失。双方都有过错的，各自承担相应责任。赔偿范围包括因准备履行合同而产生的费用等实际损失。例如，因无效条款导致的额外费用支出、利润损失等。
三、有效部分的履行
合同部分无效不影响其他部分效力的，双方当事人应按有效部分的约定继续履行合同义务。例如，在建设工程合同中，关于质量标准和付款方式的条款有效，则双方应依约履行，若一方不履行有效部分的义务，另一方有权要求其承担违约责任，包括支付拖欠款项、继续履行合同等。
四、争议解决条款的独立性
合同中独立存在的争议解决方法条款（如仲裁条款）不受合同部分无效的影响，仍然有效。当双方就合同履行或无效部分的处理发生争议时，应按照约定的争议解决方式处理，这有助于快速、有效地解决纠纷，减少当事人的诉讼成本。
五、特殊情况处理
如果合同部分无效严重影响了其他部分的效力，导致整个合同无法继续履行或失去了履行的意义，当事人可以请求法院或仲裁机构确认整个合同的无效或解除整个合同。此种情况下，需由专业的法律机构进行具体判断和处理，以确保裁决的公正性和合理性。
六、实际案例说明
假设甲乙双方签订了一份房屋租赁合同，其中约定租赁房屋用于非法活动（如传销），同时约定了合法的租金支付和房屋交付条款。在此情况下，租赁用途条款因违反法律法规强制性规定而无效，但租金支付和房屋交付等条款若合法则仍有效。双方应继续履行合法条款所规定的义务，同时就无效条款的处理进行协商或寻求司法救济。
总结与建议：在处理合同部分有效、部分无效的情况时，应严格遵循法律规定，认真审查合同内容，准确判断有效和无效的部分，并根据实际情况采取相应的措施来维护当事人的合法权益。若您遇到类似问题或有任何疑问，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律意见和指导。