结论：被执行人已还清欠款但仍在执行的情况下，能否申请执行人责任，需根据具体情况来判断。一般来说，如果执行程序存在错误或执行人存在违法行为，被执行人可以依法追究执行人的责任。

分析说明：

1. 执行程序错误：

   • 如果在执行过程中，执行法院或执行人员存在程序错误，如未依法送达执行通知、未依法进行听证等，导致被执行人权益受损，被执行人可以依法提出执行异议，并要求执行法院纠正错误。
   • 在此情况下，如果执行程序错误导致被执行人被错误执行，被执行人不仅可以要求停止执行，还可以依法追究执行人员的责任，包括申请国家赔偿等。

2. 执行人违法行为：

   • 如果执行人在执行过程中存在违法行为，如滥用职权、徇私舞弊、贪污受贿等，被执行人可以向相关部门举报，并要求追究执行人的法律责任。
   • 在此情况下，被执行人不仅可以要求停止执行，还可以根据违法行为的性质和后果，要求执行人承担民事赔偿责任、行政责任甚至刑事责任。

3. 已还清欠款但仍在执行的情况：

   • 如果被执行人已经还清欠款，但执行程序仍在继续，这可能是由于执行法院或执行人员未及时更新执行信息、未依法终止执行程序等原因导致的。
   • 在此情况下，被执行人可以向执行法院提出执行异议，要求终止执行程序，并说明已经还清欠款的事实。如果执行法院未依法处理，被执行人还可以依法向上级法院申请复议或提起诉讼。

行动建议：

• 收集证据：被执行人应收集相关证据，如还款凭证、执行通知书、执行异议申请书等，以证明自己已经还清欠款且执行程序存在错误或违法行为。
• 提出异议：被执行人应及时向执行法院提出执行异议，要求终止执行程序并纠正错误。
• 寻求法律援助：如果被执行人不确定如何操作或担心自己的权益无法得到保障，可以寻求专业律师的法律援助，以便更好地维护自己的合法权益。

法律后果：

• 如果被执行人能够证明执行程序存在错误或执行人存在违法行为，并依法提出异议或举报，那么执行程序可能会被终止或纠正，执行人可能会承担相应的法律责任。
• 如果被执行人未能及时提出异议或举报，或者未能提供充分证据证明自己的主张，那么可能会继续承受不必要的执行压力或损失。

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