擅自更换车牌被交警发现，将面临行政处罚，具体处理方式如下：

1. 行政处罚依据
   根据《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条及第九十六条规定，任何单位或个人不得擅自改变机动车登记结构、构造或特征，包括车牌。若被查实存在伪造、变造或使用其他车辆号牌的行为，交警将依法扣留机动车，并处以2000元以上5000元以下罚款，同时可并处15日以下拘留。若涉及使用伪造、变造号牌，还将收缴非法牌证，并扣留车辆直至违法行为消除。

2. 具体处理流程

   • 现场查扣：交警发现违法行为后，会当场扣留车辆及非法车牌，并要求驾驶人出示驾驶证、行驶证等证件。
     
   • 调查取证：通过车辆登记信息、监控录像等核实车牌来源及使用情况，确认是否涉及盗抢、套牌等更严重违法行为。
     
   • 处罚决定：根据调查结果，出具《行政处罚决定书》，明确罚款金额、拘留期限（如有）及车辆返还条件。
     
   • 执行与复议：当事人需在规定期限内缴纳罚款、接受拘留；若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

3. 特殊情形说明

   • 临时使用其他车牌：即使出于“临时借用”等理由，只要未依法申请临时号牌或变更登记，均构成违法。
     
   • 车牌被盗后未报案：若车牌被盗未及时报警，导致他人冒用，车主可能需承担部分举证责任，但最终处罚仍针对实际使用非法车牌的行为人。
     
   • 单位车辆违法：若车辆属单位所有，除处罚驾驶人外，单位作为管理方也可能因监管不力被追责。

4. 长期影响

   • 违法记录：处罚信息将录入交通管理信息系统，影响个人或单位信用评级。
     
   • 车辆年检：未处理完违法行为前，车辆无法通过年检。
     
   • 保险理赔：若因擅自更换车牌导致事故责任认定争议，保险公司可能拒赔或减赔。

建议：若已发生此类行为，应立即配合交警调查，主动说明情况并接受处罚；若车牌被盗，需第一时间报警并保留报案回执，避免后续纠纷。如有其他疑问，可直接向我咨询具体法律问题。