借款协议中变更受益人需通过签订补充协议的方式完成，核心要点是确保变更行为合法有效并避免纠纷，具体操作如下：

1. 明确变更主体及法律关系
   借款协议的“受益人”通常指债权受让人（即接收债权的一方）或实际收款人。若需变更，需确认原协议是否允许债权转让（如协议中有“禁止转让”条款，则变更可能无效）。若允许，需由原债权人（出借人）、债务人（借款人）及新受益人三方签署《补充协议》，明确原债权债务关系不变，仅变更收款方或债权归属。

2. 补充协议的核心条款

   • 变更事项：写明原协议名称、编号、签订日期，明确变更内容（如“原协议第X条约定的收款账户变更为XXX，账户名变更为XXX”）。
     
   • 三方权利义务：
     
     • 原债权人声明放弃原受益人身份，新受益人确认接受债权；
       
     • 债务人确认向新受益人履行还款义务，原还款方式（如银行转账）需同步变更；
       
     • 约定变更生效时间（如“自三方签字盖章之日起生效”）。
       
   • 违约责任：若因变更导致债务人重复还款或未收到款项，需约定责任承担方（如新受益人未及时通知债务人变更信息，由其承担损失）。
     

3. 法律要件及形式要求

   • 书面形式：根据《民法典》第469条，债权转让需采用书面形式，口头变更无效。
     
   • 通知债务人：若仅变更收款账户（非债权转让），需由原债权人或新受益人书面通知债务人；若涉及债权转让，根据《民法典》第546条，债权人未通知债务人的，该转让对债务人不发生效力。
     
   • 公证或见证：为增强证据效力，可对补充协议进行公证，或由第三方（如律师事务所）见证签署过程。
     

4. 风险提示

   • 若原协议约定“变更需经全体协议方同意”，则单方变更无效；
     
   • 变更后需销毁原协议中涉及旧受益人的条款（如复印件），避免混淆；
     
   • 若涉及跨境支付或税务问题（如新受益人为境外主体），需提前咨询税务及外汇管理部门。
     

示例条款（供参考）：

“经三方协商一致，对《借款协议》（编号：XXX）作如下变更：

1. 原协议第X条‘出借人指定收款账户为：XXX’变更为‘新受益人指定收款账户为：XXX，账户名：XXX’；
   
2. 自本补充协议生效之日起，债务人应向新账户履行还款义务，原账户不再接收款项；
   
3. 本补充协议与原协议冲突的，以本协议为准。”
   

如有具体协议文本或变更场景，可进一步提供细节，我将协助起草或审核条款。