结论前置：在女方婚内零首付贷款购买运营车辆、男方负债且女方还贷款的情况下，起诉离婚时车辆及债务的分割需综合考虑车辆性质、贷款偿还情况、债务用途及双方经济状况等因素。以下为具体分析：

1. 车辆分割：

   • 车辆性质认定：首先需明确车辆是否属于夫妻共同财产。若车辆购买于婚姻关系存续期间，且未明确约定为个人财产，则一般视为夫妻共同财产。
   • 贷款偿还情况：女方在婚内负责偿还车辆贷款，这部分还款可能被视为对共同财产的贡献。在分割时，法院可能会考虑女方还款的具体金额及时间，适当调整分割比例。
   • 分割原则：根据《民法典》相关规定，夫妻共同财产应平等分割。但考虑到女方还款的实际情况，法院可能会判决女方获得车辆所有权或较大比例的车辆价值，同时要求女方补偿男方相应金额。

2. 债务处理：

   • 债务性质认定：需明确男方负债的性质。若债务用于夫妻共同生活或共同经营，则可能被视为夫妻共同债务；若债务为男方个人消费或非法活动所负，则可能被视为男方个人债务。
   • 共同债务处理：若债务被认定为夫妻共同债务，双方需共同承担还款责任。在离婚时，法院可能会根据双方经济状况及债务情况，判决双方按比例承担债务。
   • 个人债务处理：若债务被认定为男方个人债务，则由男方自行承担还款责任。女方在离婚时无需承担该部分债务。

3. 综合考量因素：

   • 双方经济状况：法院在判决时会考虑双方的经济状况，包括收入、财产、负债等，以确保判决的公平性和合理性。
   • 子女抚养情况：若双方有子女，法院还会考虑子女的抚养权和抚养费问题，这可能对财产分割和债务处理产生影响。
   • 过错因素：若一方存在过错（如出轨、家暴等），法院在判决时可能会考虑过错因素，对无过错方进行适当倾斜。

建议：在起诉离婚前，建议双方先进行协商，尝试达成财产分割和债务处理的协议。若协商无果，可寻求法律援助或委托律师代理诉讼。在诉讼过程中，应提供充分的证据证明车辆购买、贷款偿还及债务情况，以便法院作出公正判决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。