结论：在询问笔录中当事人未认可违法事实的情况下，行政机关是否可以下达处罚告知书，这并非一个绝对禁止或绝对允许的行为，而是需要根据具体情况进行综合判断。
分析说明：
行政处罚的基本原则：
- 行政处罚应当遵循公正、公开的原则，确保当事人的合法权益不受侵犯。在作出行政处罚决定前，行政机关应当充分听取当事人的意见，保障其陈述和申辩的权利。
询问笔录的作用：
- 询问笔录是行政机关在调查取证过程中，对当事人或相关人员进行询问并记录其陈述的书面材料。它作为证据的一种，对于认定违法事实、确定处罚依据具有重要作用。然而，询问笔录本身并不直接决定行政处罚的作出，而是作为行政机关作出处罚决定时的参考依据之一。
当事人未认可违法事实的情况：
- 如果当事人在询问笔录中明确表示不认可违法事实，行政机关不能仅凭此笔录就直接认定其违法并下达处罚告知书。行政机关需要进一步调查取证，收集其他相关证据来支持其处罚决定。这些证据可能包括现场勘查记录、物证、书证、证人证言等。
- 如果行政机关在综合调查后，认为有足够的证据证明当事人存在违法行为，即使当事人在询问笔录中未认可，行政机关仍然可以依法下达处罚告知书，并告知当事人其享有的陈述和申辩权利。
法律程序的要求：
- 在下达处罚告知书前，行政机关应当确保已经履行了必要的调查程序，收集了充分的证据来支持其处罚决定。同时，行政机关还应当告知当事人其违法行为的事实、理由、依据以及拟作出的行政处罚内容，并听取当事人的陈述和申辩。
法律建议：
- 对于行政机关：在作出行政处罚决定前，务必确保已经收集了充分的证据来支持其处罚决定，并充分听取当事人的意见，保障其陈述和申辩的权利。如果当事人在询问笔录中未认可违法事实，行政机关应当进一步调查取证，避免仅凭单一证据就作出处罚决定。
- 对于当事人：如果收到行政机关的处罚告知书，但认为自己并未违法或认为行政机关的处罚决定缺乏依据，可以及时向行政机关提出陈述和申辩，甚至可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。
后续行动指南：
- 如果您是行政机关工作人员，在处理此类案件时，请务必遵循法定程序，确保处罚决定的合法性和合理性。
- 如果您是当事人，对行政机关的处罚决定有异议，请及时咨询专业律师（即我，刘雅宁律师，专注于合同纠纷、公司事务领域），了解自己的法律权益和可能的救济途径。
如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。