结论：针对您提出的“协议中规定未按通知的时间去办理结算手续后果自负，但现在有两个通知”的问题，这主要涉及到协议条款的解释与适用，以及可能产生的法律后果。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 协议条款的解释：

   • 首先，需要明确协议中“未按通知的时间去办理结算手续后果自负”这一条款的具体含义。这通常意味着，如果一方未按照另一方通知的时间去办理结算，那么由此产生的任何不利后果将由未按时办理结算的一方自行承担。
   • 当存在两个通知时，关键在于确定哪个通知是有效的，或者是否两个通知都有效且需要分别遵守。这通常取决于协议的具体内容、双方的行为以及可能存在的行业惯例或交易习惯。

2. 两个通知的情况分析：

   • 情况一：两个通知内容一致：如果两个通知在内容上完全一致，只是发送时间或方式不同，那么通常可以认为这两个通知都是有效的，且办理结算的时间应以最后一个通知为准（除非协议另有规定）。在这种情况下，如果一方未按照通知的时间去办理结算，那么将承担由此产生的不利后果。
   • 情况二：两个通知内容不一致：如果两个通知在内容上存在差异，比如办理结算的时间、地点或方式等不同，那么就需要进一步分析哪个通知是有效的。这通常取决于通知的发送顺序、双方的行为以及协议中的相关规定。如果协议中明确规定了通知的发送顺序或优先级，那么应按照协议的规定来确定哪个通知是有效的。如果协议中没有明确规定，那么可能需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决争议。

3. 可能的法律后果：

   • 如果一方未按照有效的通知去办理结算，那么根据协议条款，该方可能需要承担由此产生的不利后果，如支付违约金、赔偿损失等。
   • 如果双方对哪个通知是有效的存在争议，且无法通过协商或调解解决，那么任何一方都有权向法院提起诉讼，请求法院对争议进行裁决。

4. 建议与措施：

   • 在面对这种情况时，建议双方首先回顾协议的具体内容，特别是关于通知发送和结算办理的相关条款。
   • 如果协议中有明确规定，那么应按照协议的规定来执行；如果协议中没有明确规定，那么双方应尝试通过协商或调解来解决争议。
   • 如果协商或调解无果，那么任何一方都有权寻求法律途径来解决争议，包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。

进一步思考：在处理此类问题时，除了关注协议条款和通知内容外，还需要考虑双方的行为、交易习惯以及可能存在的行业惯例等因素。这些因素都可能对争议的解决产生重要影响。因此，在处理此类问题时，建议双方保持冷静、理性，并尽可能通过协商或调解等和平方式来解决争议。如果确实无法达成一致，那么再寻求法律途径来解决也不迟。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。