结论前置：公司持有其他公司股份的情况下，是否可以注销，主要取决于公司自身的决策程序是否符合法律规定，以及是否满足注销的法定条件，与是否持有其他公司股份无直接关系。在符合法定条件和程序的情况下，公司可以依法进行注销。
详细分析：
一、公司注销的决策程序
有限责任公司：
- 根据《公司法》的相关规定，有限责任公司的解散需要经代表三分之二以上表决权的股东通过。这意味着，只要公司内部能够形成这样的决议，即使公司持有其他公司的股份，也不影响其自身的注销决策。
- 如果公司章程有特别约定，如解散需要更高比例的股东同意，则需遵循公司章程的规定。
股份有限公司：
- 股份有限公司的解散同样需要经出席股东大会会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。这一规定与有限责任公司类似，不受公司是否持有其他公司股份的影响。
二、公司注销的法定条件
清算义务：
- 在决定注销公司前，必须成立清算组，对公司财产进行清算，处理与清算有关的公司未了结的业务，清缴所欠税款以及清算过程中产生的税款，清理债权、债务，并处理公司清偿债务后的剩余财产等。
- 清算组需在成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内在报纸上公告。债权人应当自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，向清算组申报其债权。
注销登记：
- 清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
三、持有其他公司股份对注销的影响
- 公司持有其他公司股份，并不构成其自身注销的障碍。在注销过程中，公司需要处理其持有的其他公司股份，这通常通过股权转让、减资或其他合法方式实现。
- 如果公司持有的其他公司股份存在纠纷或争议，可能需要先解决这些纠纷或争议，再进行注销程序。但这并不改变公司可以依法注销的基本事实。
四、法律建议
提前规划：
- 在决定注销公司前，应提前规划好清算和注销的流程，确保每一步都符合法律规定。
- 如果公司持有其他公司股份，应考虑如何处理这些股份，以避免在注销过程中产生不必要的纠纷。
咨询专业律师：
- 注销公司是一个复杂的法律过程，涉及多个方面的法律问题。因此，建议公司在注销前咨询专业律师，以确保注销过程的合法性和顺利性。
- 如果你有任何关于公司注销的法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。
综上所述，公司持有其他公司股份并不影响其自身的注销决策和程序。只要公司能够按照法律规定形成解散决议，并满足注销的法定条件，就可以依法进行注销。