若股份代持协议对方不配合取消，核心结论是可通过协商、诉讼或仲裁等法律途径解决，具体分情况如下：

1. 协商解除
   首先可尝试与对方协商，明确解除代持协议的意愿及条件（如股权转让方式、对价支付等）。若双方达成一致，应签订书面解除协议，明确权利义务终止时间、股权归属及违约责任，避免后续纠纷。协商成功的关键在于双方对股权处置无实质性争议，且解除协议不违反法律强制性规定（如《公司法》对股权转让的限制）。

2. 诉讼解除
   若协商无果，可向法院提起诉讼，主张解除代持协议。根据《民法典》第五百六十三条，若对方存在根本违约（如拒绝配合办理股权变更登记、擅自处分股权等），或因不可抗力导致协议目的无法实现，法院可判决解除协议。诉讼中需提供证据证明对方不配合的事实（如沟通记录、催告函等），以及协议解除的合法性依据。判决生效后，可凭法院文书要求公司办理股权变更登记。

3. 仲裁解除（若协议有仲裁条款）
   若代持协议中约定了仲裁条款，则需向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁程序与诉讼类似，但需注意仲裁一裁终局，效率较高。仲裁中同样需证明对方不配合解除协议的行为构成违约或协议存在法定解除事由。仲裁裁决生效后，可凭裁决书要求公司配合变更股权登记。

4. 特殊情形处理

   • 隐名股东显名化：若代持协议解除后，隐名股东需显名成为公司股东，需经公司其他股东半数以上同意（《公司法》第七十一条）。若其他股东拒绝，可能需通过诉讼确认股东资格，再办理变更登记。
     
   • 股权代持无效情形：若代持协议因违反法律强制性规定（如外商投资准入负面清单、公务员持股限制等）被认定无效，则双方应返还财产、赔偿损失，此时无需对方配合即可直接主张协议无效。

行动建议：

• 优先通过书面催告（如律师函）固定对方不配合的证据，为后续诉讼或仲裁做准备。
  
• 若涉及复杂股权结构或公司控制权争议，建议同步申请财产保全或行为保全，防止对方转移股权。
  
• 解除协议后，务必督促公司及时办理工商变更登记，避免股权状态持续不明导致法律风险。
  

如有进一步细节需分析（如协议条款、对方不配合的具体表现等），可直接向我咨询。