委托加工并附有投资的合作协议，其法律性质主要取决于协议的具体内容、双方的权利义务安排以及实际履行情况，但一般可归结为混合性合同或联营合同。以下是对此问题的详细分析：

1. 混合性合同的角度：

   • 定义与特征：混合性合同是指合同中包含了两种或两种以上不同类型合同的特征和要素。在委托加工并附有投资的合作协议中，既包含了委托加工的法律关系（即一方委托另一方进行加工生产），又包含了投资合作的法律关系（即双方共同投资、共享收益、共担风险）。
   • 法律适用：对于混合性合同，法律上通常采取“分别适用”的原则，即根据合同中不同部分的内容，分别适用相应的法律条款。例如，委托加工部分可能适用《中华人民共和国民法典》中关于承揽合同的规定，而投资合作部分则可能适用《中华人民共和国公司法》或《中华人民共和国合伙企业法》中关于股权或合伙的规定。

2. 联营合同的角度：

   • 定义与特征：联营合同是指两个或两个以上的经济组织为了实现共同的经济目的，按照法律规定或合同约定，通过联合经营的方式所订立的合同。在委托加工并附有投资的合作协议中，如果双方不仅共同投资，还共同参与经营管理、共享收益、共担风险，那么该协议就具有联营合同的特征。
   • 法律适用：对于联营合同，法律上有专门的规定，如《中华人民共和国民法典》中关于联营的规定。如果合作协议符合联营合同的特征，那么双方应按照联营合同的相关规定来履行义务、享受权利，并承担相应的法律责任。

法律建议：

• 明确协议内容：在签订委托加工并附有投资的合作协议时，双方应明确协议的具体内容、权利义务安排以及实际履行方式，以避免因协议内容模糊而引发的法律纠纷。
• 选择适当的法律形式：根据双方的合作目的和实际情况，选择适当的法律形式（如公司、合伙企业等）来规范双方的合作行为，以更好地保护双方的合法权益。
• 咨询专业律师：由于委托加工并附有投资的合作协议涉及多个法律领域，且法律关系复杂，因此建议双方在签订协议前咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。

可能法律后果：

• 如果协议内容违反法律法规的强制性规定，那么该协议可能被认定为无效合同，双方将无法依据该协议主张权利或履行义务。
• 如果双方在履行协议过程中发生纠纷，且无法通过协商解决，那么可能需要通过诉讼或仲裁等法律途径来解决纠纷，这将给双方带来一定的法律成本和经济损失。

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