公司赔偿工资如果仅按照底薪赔偿，在多数情况下是违法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景与规定

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者因公司原因遭受损失（如工伤、违法解除劳动合同等）时，公司应支付的赔偿或补偿通常应包含劳动者应得的全部工资，而不仅仅是底薪。工资一般包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入。因此，如果公司仅按照底薪进行赔偿，很可能违反了相关法律法规的规定。

不同情况下的赔偿标准

1. 工伤赔偿：

   • 在工伤情况下，劳动者的赔偿应包括医疗费、停工留薪期工资、一次性伤残补助金等。其中，停工留薪期工资应按照劳动者受伤前的平均工资计算，而非仅底薪。
   • 如果公司仅按照底薪支付停工留薪期工资，那么这种做法是违法的。

2. 违法解除劳动合同赔偿：

   • 如果公司违法解除劳动合同，根据《劳动合同法》的规定，劳动者有权要求公司支付经济补偿金或赔偿金。经济补偿金或赔偿金的计算基数通常是劳动者解除劳动合同前的平均工资，包括底薪、奖金、津贴等所有收入。
   • 因此，如果公司仅按照底薪支付经济补偿金或赔偿金，同样违反了法律规定。

3. 其他赔偿情况：

   • 在其他涉及工资赔偿的情况下，如未按时支付工资、克扣工资等，公司也应按照劳动者的实际工资收入进行赔偿，而非仅底薪。

法律建议与后果

• 法律建议：如果你发现公司仅按照底薪进行赔偿，你可以先与公司协商，要求公司按照法律规定支付全部工资赔偿。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 法律后果：如果公司违反法律规定，仅按照底薪进行赔偿，那么公司可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，公司还可能需要承担因违法赔偿而产生的额外法律责任，如支付赔偿金、利息等。

实际操作中的注意事项

• 保留证据：在与公司协商或申请劳动仲裁时，务必保留好相关证据，如工资条、劳动合同、解除劳动合同通知书等，以证明你的实际工资收入和公司的违法行为。
• 了解程序：在申请劳动仲裁前，建议先了解当地的劳动仲裁程序和规定，以便更好地维护自己的权益。

综上所述，公司赔偿工资如果仅按照底薪赔偿，在多数情况下是违法的。如果你遇到这种情况，建议及时与公司协商或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤或工资福利方面的问题，可以直接向我咨询。