结论：个体工商户贷款逾期是否会从账户上自动扣款，需分情况讨论，主要取决于贷款合同约定、账户性质以及是否授权自动扣款等因素。以下为具体分析：

1. 贷款合同中有明确约定自动扣款条款
   若贷款合同中明确约定了“逾期时贷款方有权从借款人指定账户中自动扣款”，且该条款不违反法律强制性规定（如未侵犯借款人基本生存权益），则贷款方有权依据合同约定直接划扣账户资金。此时，即使借款人未主动还款，贷款方仍可通过系统自动完成扣款操作。

2. 贷款合同未约定自动扣款，但借款人曾签署授权文件
   若贷款合同未直接约定自动扣款，但借款人在办理贷款时另行签署了《授权扣款协议》或类似文件，明确授权贷款方在逾期时从其账户中扣款，则贷款方同样有权依据授权文件进行划扣。此类授权通常需借款人以书面形式明确同意，且扣款范围、条件等需符合法律规定。

3. 既无合同约定也无授权，贷款方无权自动扣款
   若贷款合同中未约定自动扣款条款，且借款人未签署任何授权文件，则贷款方无权单方面从借款人账户中划扣资金。此时，贷款方需通过合法途径催收欠款，如发送催款通知、提起诉讼或申请仲裁等。若贷款方擅自扣款，可能构成侵权或违约，借款人可依法主张权利。

4. 特殊账户性质可能影响扣款
   若借款人账户为社保账户、公积金账户等专项账户，或账户内资金为最低生活保障金、抚恤金等专项资金，则贷款方通常无权扣划。此类资金受法律特别保护，即使存在逾期，贷款方也需通过其他合法途径追偿，而非直接扣划。

建议：

• 若您已签署自动扣款协议，建议确保账户内资金充足，避免因扣款失败导致逾期记录；
  
• 若您未签署此类协议，但贷款方擅自扣款，可保留相关证据（如银行流水、扣款通知等），并通过协商、投诉或诉讼等方式维护权益；
  
• 若对贷款合同条款或扣款行为存在疑问，可直接向我咨询，我将结合具体合同内容及法律规定为您详细分析。