缴纳违法停车罚款后，被扣的分数不会自动免除，需通过相应周期或特定程序恢复。具体分析如下：

1. 违法停车的处罚构成
   根据《道路交通安全法》第九十三条，违法停车的处罚通常包括罚款和扣分（部分情形仅罚款）。例如，在设有禁止停车标志的路段停车，可能被处以200元罚款并记3分。罚款与扣分是独立的处罚措施，缴纳罚款仅履行了经济处罚义务，不涉及记分清除。

2. 记分恢复的法定规则

   • 周期自动恢复：根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，驾驶证记分周期为12个月，从初次领证日期计算。在一个周期内，记分未达到12分的，所记分数会在周期结束时自动清零（例如，初次领证日期为5月1日，则次年4月30日24时清零）。
     
   • 满分学习要求：若周期内记分达到12分，需参加交通安全教育并重考科目一，合格后方可清零记分。

3. 特殊情形下的记分处理

   • 现场处罚与电子抓拍差异：若违法停车被交警现场开具《处罚决定书》，需在15日内缴纳罚款，否则可能产生滞纳金，但记分仍需通过周期恢复；若被电子监控抓拍，需在收到通知后按规定处理，记分规则相同。
     
   • 行政复议或诉讼影响：若对处罚有异议并提起复议或诉讼，在裁决生效前，记分可能暂不生效，但若裁决维持原处罚，记分仍需按规则处理。

4. 实务建议

   • 及时查询记分状态：可通过“交管12123”APP或当地车管所查询驾驶证记分情况，避免因未及时处理导致记分累积。
     
   • 区分罚款与记分性质：缴纳罚款不等于记分清除，需关注记分周期结束时间，合理安排违章处理时间。
     
   • 谨慎处理满分情形：若记分接近12分，建议减少驾驶行为或通过学习减分政策（如部分地区允许通过交管APP学习减1分）降低风险。

总结：违法停车罚款与扣分是独立处罚措施，缴纳罚款后需等待记分周期结束或通过满分学习程序恢复记分。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或地方性政策差异。