驾驶员因交通事故负全责被单扣绩效奖金，这一做法是否合法，需结合具体情况分析，不能一概而论。以下从不同角度为你详细阐述：
一、劳动合同或公司规章制度有明确规定的情况
若劳动合同或公司规章制度中明确规定，驾驶员因自身原因导致交通事故且负全责时，公司有权扣除其绩效奖金：
- 在这种情况下，公司扣除绩效奖金的行为通常被视为合法。因为劳动合同和公司规章制度是双方自愿达成的协议，具有法律约束力。只要这些规定不违反法律法规的强制性规定，不侵犯员工的合法权益，公司就有权依据这些规定对员工进行管理。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三条，订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。
但需注意，公司规章制度需经过民主程序制定，并向员工公示或告知：
- 如果公司规章制度未经民主程序制定，或者未向员工公示或告知，那么这些规定可能对员工不产生法律效力。此时，公司依据这些规定扣除绩效奖金的行为可能被视为违法。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
二、劳动合同或公司规章制度无明确规定的情况
若劳动合同或公司规章制度中未明确规定驾驶员因交通事故负全责时公司可扣除绩效奖金：
- 在这种情况下，公司扣除绩效奖金的行为可能缺乏法律依据。因为公司不能随意扣除员工的绩效奖金，除非有明确的合同或制度依据。
- 建议：驾驶员可以与公司进行协商，要求公司说明扣除绩效奖金的具体理由和依据。如果公司无法提供合理的解释和依据，驾驶员可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
即使公司认为驾驶员存在过错，也应通过合理方式处理：
- 公司不能仅凭驾驶员的一次过错就随意扣除其绩效奖金。公司应该根据驾驶员的过错程度、造成的损失大小以及公司的相关规定，采取合理的处理方式，如警告、罚款（需符合法律法规规定）、培训等。
三、其他注意事项
扣除绩效奖金的数额需合理：
- 即使公司有权扣除驾驶员的绩效奖金，扣除的数额也应合理。公司不能随意扣除大量绩效奖金，导致驾驶员的生活受到严重影响。
- 建议：驾驶员可以要求公司说明扣除绩效奖金的具体数额和计算方式，确保扣除的数额合理合法。
驾驶员应保留相关证据：
- 如果驾驶员认为公司扣除绩效奖金的行为违法或不合理，应保留相关证据，如劳动合同、公司规章制度、交通事故责任认定书、绩效奖金扣除通知等。这些证据将有助于驾驶员在协商、投诉或申请劳动仲裁时维护自己的合法权益。
总结来说，驾驶员因交通事故负全责被单扣绩效奖金是否合法，需结合劳动合同、公司规章制度以及具体情况来分析。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的法律建议。