在判决书中扣减预付赔偿款时，通常可以这样表述：

1. 明确预付赔偿款的事实：

   • 判决书首先应确认被告已向原告预付了部分赔偿款的事实，包括预付的时间、金额及支付方式等。例如：“经审理查明，被告XX公司于XXXX年XX月XX日向原告XX支付了预付赔偿款人民币XX元。”

2. 阐述扣减预付赔偿款的依据和理由：

   • 接着，判决书应说明扣减预付赔偿款的法律依据和具体理由。这通常涉及双方之间的合同约定、法律规定或公平原则等。例如：“根据《中华人民共和国XX法》第XX条之规定，以及双方合同中的相关约定，被告已预付的赔偿款应在最终判决的赔偿总额中予以扣减。”或者“考虑到公平原则及双方的实际损失情况，本院决定将被告已预付的赔偿款从最终应支付的赔偿总额中扣除。”

3. 具体扣减表述：

   • 在判决赔偿总额时，应明确指出扣减预付赔偿款后的实际应支付金额。例如：“综上，本院判决被告XX公司应向原告XX支付赔偿款共计人民币XX元，扣除已预付的赔偿款人民币XX元后，实际应支付人民币XX元。”

4. 附注说明（如需）：

   • 如果预付赔偿款的扣减涉及复杂的计算过程或需要特别说明的事项，可以在判决书中附注说明。例如：“关于预付赔偿款的扣减，本院已根据双方提供的证据和法律规定进行了详细计算，具体计算过程见附件。”

示例表述： “经审理查明，被告XX公司于XXXX年XX月XX日向原告XX支付了预付赔偿款人民币50,000元。根据《中华人民共和国合同法》第一百零七条之规定，以及双方合同中的相关约定，被告已预付的赔偿款应在最终判决的赔偿总额中予以扣减。综上，本院判决被告XX公司应向原告XX支付赔偿款共计人民币100,000元，扣除已预付的赔偿款人民币50,000元后，实际应支付人民币50,000元。”

在撰写判决书时，务必确保表述清晰、准确，避免产生歧义。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。