仅凭有转款记录且双方都承认这一事实，并不能直接认定款项性质为借款或者保管，需要结合其他证据和事实进行综合判断。以下从不同角度进行分析：
认定为借款的情况
- 存在借款合意：如果双方在转款前后有明确的借款意思表示，比如通过聊天记录、书面协议、口头约定（有其他证人可以证明）等方式表明这笔钱是借款，且约定了还款期限、利息等相关事项，那么即使只有转款记录和双方的承认，也较容易认定为借款关系。例如，甲向乙转账5万元，在转账前甲明确告知乙这是借给乙应急用的，乙表示同意并在之后也承认这笔钱是借款，这种情况下就可以认定借款关系成立。
- 符合借款交易习惯：如果双方的交易行为符合借款的通常做法，比如甲经常向乙提供小额借款，每次都有转款记录且乙按时还款，这次转款记录和双方承认的情况与以往的借款模式一致，那么也可以认定为借款。
认定为保管的情况
- 存在保管合意：若双方明确表示这笔钱是委托一方进行保管的，比如甲因为要出差一段时间，将一笔钱交给乙保管，双方对此有清晰的沟通记录或者口头约定（有其他证人佐证），并且双方都承认这一事实，那么可以认定为保管关系。例如，甲将10万元现金交给乙，说“我这段时间不在，这钱你帮我保管一下”，乙答应，之后双方都认可这一情况，就可认定为保管。
- 符合保管的特征：从款项的使用和目的来看，如果钱一直由保管方持有，且没有用于保管方自身的利益，而是按照委托方的要求或者等待委托方的指示进行处理，符合保管行为的特点，也可以认定为保管。比如甲将一笔钱存入以乙名义开设的账户，但该账户的密码等由甲掌握，乙只是名义上的账户持有人，实际款项的使用权在甲，这种情况下结合双方承认的事实，可能认定为保管。
难以认定的情况及建议
如果双方只是承认有转款这一行为，但对于款项的性质各执一词，又没有其他证据能够证明是借款或者保管，那么就难以直接认定。在这种情况下，可能需要进一步收集证据，比如寻找能够证明双方当时真实意思表示的证人、查找相关的聊天记录、邮件等书面材料。如果实在无法收集到有效证据，可能会面临法律上的举证不能风险，即无法证明自己的主张。
如果遇到此类纠纷，建议及时收集和固定相关证据，如聊天记录、证人证言等，以便更好地维护自己的合法权益。 有任何疑问都可以直接向我咨询，我会结合具体情况为你提供专业的法律分析和建议。