在二拍流拍后，申请人提出以物抵债的情况下，仍然是可以提出执行异议的。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、执行异议的提出权利
在执行程序中，当事人或利害关系人认为执行行为违反法律规定的，有权向执行法院提出书面异议。这一权利并不因执行标的的拍卖次数或拍卖结果而受到影响。因此，即使在二拍流拍后，申请人提出以物抵债，其他当事人或利害关系人仍然有权对执行行为提出异议。
二、以物抵债与执行异议的关系
以物抵债的提出：在拍卖流拍后，申请执行人或其他执行债权人可以接受以物抵债，这是执行程序中的一种常见处理方式。然而，这并不意味着其他当事人或利害关系人不能对执行行为提出异议。
执行异议的独立性：执行异议是当事人或利害关系人对执行行为合法性的质疑，它独立于以物抵债的提出。即使申请人同意以物抵债，如果其他当事人或利害关系人认为执行行为存在违法之处，仍然可以提出执行异议。
三、提出执行异议的具体情形
在二拍流拍后申请人提出以物抵债的情况下，其他当事人或利害关系人可能提出执行异议的情形包括但不限于：
对拍卖程序的异议：如认为拍卖程序存在违法之处，如未依法公告、拍卖方式不当等。
对评估价值的异议：如认为评估机构对执行标的的评估价值过低或过高，损害了其合法权益。
对以物抵债协议的异议：如认为以物抵债协议存在欺诈、胁迫等情形，或者协议内容违反法律、行政法规的强制性规定。
四、提出执行异议的法律后果
执行法院的审查：执行法院在收到执行异议后，会依法进行审查，并作出裁定。如果异议成立，执行法院会裁定撤销或改正相应的执行行为；如果异议不成立，执行法院会裁定驳回异议。
对执行程序的影响：执行异议的提出可能会暂时中止执行程序，待执行法院作出裁定后再继续执行。如果异议成立且导致执行行为被撤销或改正，那么执行程序可能会因此受到影响或改变。
五、建议与注意事项
及时提出异议：如果认为执行行为存在违法之处，应及时向执行法院提出书面异议，以免错过提出异议的时机。
准备充分证据：在提出异议时，应准备充分的证据来支持自己的主张，如拍卖公告、评估报告、以物抵债协议等。
咨询专业律师：由于执行异议涉及复杂的法律程序和实体问题，建议在提出异议前咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。
综上所述，即使在二拍流拍后申请人提出以物抵债，其他当事人或利害关系人仍然有权提出执行异议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。