二次重新鉴定伤残时，鉴定机构一般不会单纯以体检报告为基础出具鉴定意见书，而是会综合多方面材料和实际检查情况来作出鉴定结论。具体分析如下：

1. 鉴定依据的全面性：伤残鉴定是一个严谨且科学的过程，鉴定机构在出具鉴定意见书时，需要依据全面、客观、真实的材料。体检报告虽然是反映被鉴定人身体状况的重要资料之一，但它通常只是对某一时刻或某一段时间内身体状况的记录，可能无法全面反映被鉴定人的伤残情况及其与事故或伤害之间的因果关系。因此，鉴定机构不会仅凭体检报告就作出鉴定结论。

2. 实际检查的必要性：在二次重新鉴定过程中，鉴定机构通常会对被鉴定人进行实际的身体检查，包括但不限于体格检查、影像学检查等，以获取第一手资料。这些实际检查的结果对于准确评估被鉴定人的伤残程度至关重要，是体检报告无法替代的。

3. 相关法规和标准的要求：伤残鉴定需要遵循相关的法规和标准，如《人体损伤致残程度分级》等。这些法规和标准对鉴定的程序、方法、依据等都有明确的规定，要求鉴定机构必须综合运用多种手段和方法进行鉴定，确保鉴定结论的客观性和准确性。因此，鉴定机构在出具鉴定意见书时，必须充分考虑所有相关因素，而不仅仅是体检报告。

4. 鉴定意见书的形成过程：鉴定意见书是鉴定机构根据鉴定材料、实际检查情况、相关法规和标准等综合分析后形成的书面结论。在这个过程中，体检报告只是鉴定材料之一，鉴定机构会结合其他材料和实际检查情况，对被鉴定人的伤残程度进行全面评估，并据此出具鉴定意见书。