核心结论：有摩托车驾驶证驾驶无合法手续的“黑头”摩托车（通常指无牌、无证或拼装、报废车辆），即使没有其他违规行为，车辆仍可能被依法扣留，驾驶人需配合处理并承担相应法律责任。具体处理方式需分情况讨论：

1. 车辆性质为“无牌”或“未登记”

• 法律依据：根据《道路交通安全法》第8条、第95条，机动车需经公安机关交通管理部门登记后才能上路行驶。未悬挂号牌的机动车不得上路，否则可扣留车辆并处20-200元罚款，驾驶证记9分。
• 处理方式：
  • 若车辆有合法来源（如购买发票、合格证等），需补办登记手续（如上牌、缴纳购置税等），凭相关证明到交警部门接受处罚后领回车辆。
  • 若车辆无法补办登记（如不符合国家标准、拼装车等），车辆可能被强制报废，驾驶人需承担罚款，驾驶证可能被吊销（如驾驶拼装车）。

2. 车辆性质为“拼装”或“报废”

• 法律依据：根据《道路交通安全法》第100条，驾驶拼装或已达报废标准的机动车上路的，公安机关交通管理部门应收缴车辆、强制报废，并对驾驶人处200-2000元罚款，吊销驾驶证。
• 处理方式：
  • 车辆必然被强制报废，驾驶人需接受罚款并承担吊销驾驶证的后果。若对车辆性质有异议（如误购报废车），可提供购买合同等证据申诉，但法律责任难以完全免除。

3. 车辆来源不合法（如盗抢、套牌）

• 特殊风险：若车辆涉及盗抢、套牌等违法行为，驾驶人可能因“使用伪造、变造号牌”或“掩饰、隐瞒犯罪所得”被追究刑事责任（如《刑法》第312条）。
• 处理方式：
  • 立即向交警说明车辆来源，配合调查。若能证明不知情（如通过正规渠道购买但未核实车辆手续），可能仅承担行政责任；若明知车辆有问题仍驾驶，可能面临刑事处罚。

关键建议

1. 配合调查：主动向交警提供车辆来源证明（如购车合同、发票）、驾驶证等材料，说明情况。
2. 核实车辆性质：通过交警部门查询车辆是否为拼装、报废或盗抢车辆，避免因信息不对称承担额外责任。
3. 法律后果评估：若车辆无法合法化，需接受罚款、吊销驾驶证等处罚；若涉及刑事风险，尽快委托律师介入。

温馨提示：驾驶无合法手续的摩托车风险极高，不仅可能面临行政处罚，还可能因车辆安全性能不达标引发交通事故，危及自身和他人安全。建议今后选择合法登记的车辆上路，并定期检查车辆手续是否齐全。如有其他疑问，欢迎随时向我咨询。