违约付购房款是否合法，主要取决于购房合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同约定层面
合法情况：
- 如果购房合同中明确约定了购房款的支付时间、金额及违约金条款，且该条款是双方平等、自愿、协商一致的基础上达成的，那么违约付购房款（即未按照合同约定支付购房款）并支付相应的违约金是合法的。
- 例如，合同中约定购房者应在合同签订后30日内支付全部购房款，如逾期则按未支付金额的每日万分之五支付违约金。若购房者未按时支付，则开发商有权按照合同约定收取违约金。
不合法情况：
- 若合同中关于违约金的约定存在显失公平的情形，如违约金数额过高，远远超出因购房者违约给开发商造成的实际损失，则可能会被认定为不合法。此时，购房者可以请求法院或仲裁机构对违约金数额进行调整。
二、法律规定层面
违约金的约定与调整：
- 我国法律允许合同当事人自行约定违约金，但对违约金的数额有一定限制。根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
- 在判断违约金是否过高时，会综合考虑实际损失、合同履行情况、当事人过错程度及预期利益等因素。
违约责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。因此，违约付购房款，购房者除了可能需要支付违约金外，还可能需要承担其他违约责任，如继续履行合同、赔偿开发商因此遭受的损失等。
三、实际操作建议
仔细阅读合同条款：
- 购房者在签订购房合同时，应仔细阅读合同中的相关条款，特别是关于违约责任和违约金的约定。确保自己理解并同意这些条款，以避免因合同条款不清晰而引发纠纷。
及时沟通协商：
- 如果购房者因特殊原因无法按时支付购房款，应及时与开发商沟通协商，寻求延期支付或其他解决方案。避免因为拖延而导致违约责任的加重。
合理约定违约金：
- 在签订合同时，双方应基于公平、合理原则约定违约金数额。避免过高或过低的约定导致不必要的争议。如果购房者对违约金数额有异议，可以在签订合同前与开发商进行协商调整。
寻求法律帮助：
- 如果购房者对开发商扣除违约金有异议，或通过协商无法达成一致，可以通过法律途径寻求救济，如调解、仲裁或诉讼等。在此过程中，购房者可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和支持。
总结来说，违约付购房款是否合法取决于购房合同的具体约定及相关法律法规的规定。购房者在签订合同时应谨慎对待相关条款，并在遇到纠纷时及时寻求法律帮助以维护自身权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。