工厂年底压两个月工资，在不存在合法特殊情况的前提下，是不合法且不合理的。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律层面
《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。工厂压两个月工资，显然违反了这一规定，构成了对劳动者工资的拖欠。
《工资支付暂行规定》第七条：进一步细化规定，工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付，且至少每月支付一次。工厂压两个月工资，意味着劳动者需要等待两个月才能拿到应得的工资，这明显违反了按月支付工资的规定。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
二、特殊情况分析
尽管上述法律规定了工资应按月支付，但也存在一些例外情况，但这些例外情况并不适用于工厂年底压两个月工资的情形：
不可抗力因素：如自然灾害、战争等导致用人单位无法按时支付工资，但这种情况极为罕见，且工厂年底压工资通常不属于此类情形。
生产经营困难：若因生产经营困难、资金周转受到影响，且在征得本单位工会同意后，可暂时延期支付劳动者工资。但延期时间的最长限制由各省、自治区、直辖市劳动行政部门根据各地情况确定，且通常不会允许延期两个月之久。更重要的是，工厂需要证明其确实存在生产经营困难，并经过工会同意，这一程序往往较为严格，不是工厂单方面可以决定的。
三、劳动者权益保护
若工厂不存在上述合法的特殊情况而压两个月工资，劳动者可以通过以下途径维护自己的合法权益：
与用人单位协商：首先尝试与工厂管理层进行直接沟通，明确表达要求按照法律规定及时支付工资的诉求。
向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察大队提出投诉。劳动监察部门将进行调查，并根据调查结果责令工厂限期支付工资。
申请劳动仲裁：如工厂仍拒绝支付，劳动者可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求工厂支付拖欠的工资及相应的经济补偿。
提起诉讼：若对仲裁结果不满意，劳动者可在规定时间内向人民法院提起诉讼，进一步维护自己的合法权益。在诉讼过程中，若因此遭受经济损失，还可依法要求工厂赔偿相应损失。
四、实际建议
保留证据：劳动者应保留好与工厂的劳动合同、工资条、考勤记录等证据，以便在维权时提供有力支持。
及时行动：一旦发现工厂有压工资的行为，劳动者应及时采取行动，避免拖延导致维权难度增加。
寻求帮助：在维权过程中，劳动者可以寻求工会、法律援助机构等组织的帮助，以更好地维护自己的合法权益。
综上所述，工厂年底压两个月工资的行为在大多数情况下是不合法的，劳动者应了解自己的合法权益，并通过合法途径积极维护。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。