结论：农业银行信用卡3000元呆账，存在协商只还本金的可能性，但需满足一定条件且协商结果具有不确定性。以下从协商的法律依据、实际操作可能性、协商步骤及注意事项三个角度展开说明：

1. 协商的法律依据

根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第七十条，在特殊情况下，确认信用卡欠款金额超出持卡人还款能力且持卡人仍有还款意愿的，发卡银行可以与持卡人平等协商，达成个性化分期还款协议。个性化分期还款协议的最长期限不得超过5年。
关键点：

• “特殊情况”通常指因失业、重大疾病、自然灾害等不可抗力导致还款能力下降；
  
• “平等协商”意味着银行无强制要求持卡人必须接受全额还款，双方可就还款金额、期限等达成一致；
  
• 即使未明确提及“只还本金”，但法律允许协商减免利息、违约金等费用，实质上可能降低还款总额。

2. 实际操作可能性

• 银行态度：农业银行作为国有大行，对呆账处理通常较为严格，但若持卡人能证明经济困难（如提供失业证明、医疗证明等），银行可能为降低坏账率而同意减免部分费用；
  
• 欠款金额：3000元金额较小，银行处理成本与追回金额接近，协商空间相对较大；
  
• 历史还款记录：若持卡人此前无恶意透支、逾期等不良记录，银行更可能给予协商机会。

3. 协商步骤及注意事项

步骤：

1. 主动联系银行：拨打农业银行信用卡客服热线（如400-669-5599），说明呆账形成原因及当前经济状况，表达协商意愿；
   
2. 提交证明材料：根据银行要求，提供失业证明、收入证明、医疗证明等，证明还款能力不足；
   
3. 提出协商方案：明确要求只还本金，或请求减免部分利息、违约金，并说明分期还款计划（如分6期、12期偿还）；
   
4. 签订协议：若银行同意，需签订书面协议（如《个性化分期还款协议》），明确还款金额、期限及违约责任。
   

注意事项：

• 避免失联：呆账期间需保持与银行的联系，否则可能被认定为“恶意透支”，面临刑事风险；
  
• 谨慎承诺：协商的还款金额需在自身能力范围内，避免二次违约；
  
• 保留证据：协商过程中的通话录音、书面协议等需妥善保存，以备纠纷时使用。

4. 若协商失败怎么办？

若银行拒绝协商，可尝试以下途径：

• 向银保监会投诉：通过银保监会官网或12378热线投诉银行未履行平等协商义务；
  
• 寻求法律援助：若因呆账被起诉，可向法院申请调解，或委托律师介入协商；
  
• 分期还款：即使无法只还本金，也可争取延长还款期限，降低单期还款压力。

总结：农业银行信用卡3000元呆账协商只还本金虽无绝对保障，但通过主动沟通、提供证明材料及合理方案，存在较大成功可能。建议优先尝试协商，同时做好备选方案准备。如有进一步疑问，可直接向我咨询。