结论：被告起诉公司时，若公司已注销，一般情况下公司不能作为诉讼主体参与诉讼。但在特定情况下，债权人可以依法向相关责任人主张权利。
详细分析：
公司注销后的法律状态
- 公司注销意味着其法人资格完全消灭，不再具有独立的民事行为能力和诉讼主体资格。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司清算结束后，应申请注销公司登记，并公告公司终止。因此，已注销的公司无法再参与民事活动或承担民事责任，包括作为被告参与诉讼。
公司注销后的起诉问题
- 一般情况：由于已注销的公司法人资格终止，通常不能再作为原告或被告参与诉讼。这是基于《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，即起诉的原告必须是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织。已注销的公司显然不符合这一条件。
- 特殊情况：尽管公司注销后一般不能作为诉讼主体，但在以下特定情况下，债权人可以依法向相关责任人主张权利：
- 清算组成员责任：若清算组成员在公司注销过程中存在违法违规行为，如未依法履行通知和公告义务，导致债权人未及时申报债权而未获清偿，或者在清算过程中存在故意或重大过失给债权人造成损失，债权人可以起诉清算组成员，要求其承担相应赔偿责任。
- 股东责任：如果股东存在未足额出资、抽逃出资等情形，即便公司注销，债权人也有权要求股东在未出资范围内或抽逃出资范围内对公司债务承担补充赔偿责任或返还责任。
- 公司未经清算即注销：若公司未经依法清算即办理注销登记，导致公司无法进行清算，债权人可以主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。
操作建议
- 确认公司注销情况：首先，需要确认公司是否已注销，以及注销过程中是否存在违法违规行为。这可以通过查询公司登记机关的档案或相关公告来获取信息。
- 收集证据：若存在违法违规行为，如清算组成员未依法履行义务或股东未足额出资等，需要收集相关证据，如清算报告、股东出资证明、银行转账记录等，以支持自己的主张。
- 确定诉讼主体：根据具体情况，确定是否可以起诉相关责任主体，如清算组成员、股东等。这需要根据相关法律法规和案件事实进行综合分析。
- 提起诉讼：在准备好相关证据和确定诉讼主体后，可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求相关责任主体承担相应的法律责任。
总结与建议：
虽然公司注销后一般不能再作为诉讼主体参与诉讼，但在特定情况下，债权人仍有可能通过法律途径来主张自己的权益。然而，这些情况都需要具体情况具体分析，并且需要满足严格的法律条件和程序。因此，如果您在公司注销后遇到了债务纠纷问题，建议直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供准确的法律意见和帮助，确保您的合法权益得到有效维护。