结论：逾期债务还清后，一般不需要额外缴纳保证金才能开具结清证明，但需根据合同约定和实际情况判断。以下是具体分析：
合同约定优先
若您与债权人（如银行、网贷平台等）签订的借款合同中明确约定“还清欠款后需缴纳保证金才能开具结清证明”，则需按合同履行。但此类条款可能涉嫌加重借款人义务，若您认为不合理，可结合以下角度分析：
- 格式条款效力：若该条款为债权人单方制定的格式条款，且未以显著方式提示您注意（如加粗、单独说明），可能因未履行提示义务而被认定无效（《民法典》第496条）。
- 对价合理性：保证金通常用于担保债务履行，若债务已清偿，再要求缴纳保证金可能缺乏合理对价，可能被认定为“不当得利”。
无合同约定时的法律分析
若合同未约定保证金，债权人无权单方要求缴纳。结清证明是债务消灭的法定证明文件，债权人有义务出具（《民法典》第557条“债务已经履行的，合同权利义务终止”）。若拒绝出具，您可：
- 书面催告：通过邮件、短信等方式要求债权人限期出具，并保留催告记录。
- 投诉或诉讼：向当地银保监会、金融监管局投诉，或直接起诉要求出具证明并赔偿损失（如因未及时出具证明导致的额外利息、信用损失等）。
特殊场景提示
- 担保类贷款：若贷款涉及抵押/质押（如房贷、车贷），需确认是否已办理解押手续。结清证明与解押手续可能分开办理，但解押通常无需额外缴费。
- 非正规机构：若债权人为非持牌机构（如部分网贷平台），需警惕其以“保证金”名义变相收费。此类要求可能涉嫌违法，可直接向公安机关报案。
行动建议：
- 立即核对借款合同，确认是否有保证金条款；
- 若无合同依据，书面要求债权人出具结清证明，并明确拒绝缴纳保证金；
- 若遭遇推诿，可向当地金融监管部门投诉或委托律师介入处理。
如有进一步细节（如合同条款、债权人态度等），可随时补充说明，我会为您具体分析。